coeff. di coiencidenza e frequenze attese

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Il gene VI
Benjamin Lewin

Genetica
Susan L. Elrod, William D. Stansfield

Peptidi e proteine
Francesco Chillemi

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Genetica

coeff. di coiencidenza e frequenze attese

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Genetica:

Didattica

Blog Inside the Cell

Protocolli

Siti Scientifici

Quiz

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

daisy
Nuovo Arrivato

Prov.: Asti
Citt�: asti

108 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2008 : 20:51:40

ciao...Viene fatto il seguente incrocio il Drosophila:

a + b/+ c + X a c b/y

Calcola il numero di individui attesi nelle diverse classi fenotipiche nei maschi e nelle femmine sapendo che la distanza tra i geni a e c � 14um, quella tra c e b � 12um, il coeff. di coincidenza � 0,3 e il totale della progenie � 2000.

Dalla soluzione non spiegata per�, ottengo questi risultati:
Il punto di partenza � di utilizzare il valore del coeff di coincidenza per calcolare il numero dei doppi ricombinati. Una volta calcolato questo valore (si fa 1-0,3 = o,7 ricombinanti e poi...?), si utilizzano le distanza di mappa per calcolare il numero di singoli ricombinati per ciascuna classe (questo � come per il dottor spock, vero GFPina?). Sia i maschi che le femmine sono distribuiti come segue:

a + b  372
+ c +  373
a c +   67
+ + b   68
a + +   57
+ c b   58
a c b    2
+ + +    3

Non riesco proprio a capire con quale calcolo ottenga le frequenze attese...� tutta la mattina che ci provo ..

grazie

e@daisy

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 06 febbraio 2008 : 01:55:00

Allora le frequenze attese le ottieni esattamente come negli esercizi precedenti! Sono le frequenze che avresti se non ci fosse interferenza.

Quindi la frequenza attesa dei doppi ricombinanti � data da:
fr D.R. att = 14% x 12% = 1.68% = 0,0168

Non sto a calcolarti le altre perch� sono esattamente come per gli altri esercizi.

Il coefficiente di coincidenza � il rapporto tra le frequenze osservate e le frequenze attese dei doppi ricombinanti:

c = fr.DR oss/fr.DR att

quello che hai calcolato tu � l'Interferenza:
I = 1-c = 1 - 0,3 = 0,7
che per� non ti serve!

Hai calcolato la frequenza attesa dei doppi ricombinanti, conosci il coefficiente di coincidenza, quindi dalla formula ricavi la frequenza osservata dei doppi ricombinanti:

c = fr.DR oss/fr.DR att
fr.DR oss = c x fr.DR att = 0,3 x 0,0168 = 0,005

da questa calcoli i doppi ricombinanti osservati su 2000 individui
D.R. = 0,005 x 2000 = 10

Attenzione per� la progenie che hai indicato tu (non so se � il risultato che ti davano dell'esercizio) � di 1000 individui (non 2000!) perch� saranno 1000 femmine e 1000 maschi.
Comunque a questo punto ti calcoli gli individui osservati (su 1000).
I doppi ricombinanti saranno: 0,005 x 1000 = 5
infatti tra i risultati hai:
a c b 2
+ + + 3 (2+3=5)

e poi usi le distanze di mappa e questa frequenza dei doppi ricombinanti osservati per calcolarti i ricombinati singoli!

Chiaro adesso?

valgenetica
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2009 : 18:43:43

Sn una nuova iscritta alle prese cn la genetica...mi intrometto in questa discussione xk� mi � capitato un esercizio molto simile...volevo chiederti se era possibile calcolare le frequenze anche se nell'esercizio non viene dato il coefficiente di coincidenza e neanche il numero totale della progenie.grazie mille.

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2009 : 19:34:37

Si certo che puoi!
Innanzitutto se non ti d� il coefficiente di coincidenza vuol dire che non c'� interferenza ed � tutto pi� semplice.
Se anche non hai il numero totale della progenie non cambia niente, le "frequenze" che sono espresse in frequenza 0,... (con massima frequenza = 1) o in percentuale le puoi calcolare.

Comunque � spiegato tutto nel dettaglio qui: Problema: il sig spock e le distanze di mappa

Poi se cerchi un po' ci sono anche molti esercizi di questo tipo in questa sezione!