Bella domanda! Non so se è la risposta giusta, ma me ne vado per un'idea
Questa è la palindrome:
5'-AAATTT-3'
3'-TTTAAA-5'
Questo è l'enzima
>>>>
tridimensionalmente la palindrome è identica se vieni da destra o da sinistra, quindi:
>>>>
5'-AAATTT-3'
3'-TTTAAA-5'
o
5'-AAATTT-3'
3'-TTTAAA-5'
<<<<
Quindi la palindrome è vista tridimensionalmente dall'enzima come la stessa sequenza...
Inoltre non tutte le proteine vedono palindromi, ad esempio il fattore di trascrizione NF-kB vede la sequenza
5'GGGACTTTCC-3
che non è una palindrome (anche perchè la trascrizione è direzionale, quindi è giusto che sia così)