Southern Blot e bande sovrannumerarie

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jeCO85
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Inserito il - 19 luglio 2011 : 11:06:28

Ho un test in Southern Blot che mi consente di rilevare la presenza di alleli con espansione della tripletta CTG.

In condizioni normali nel campione affetto ho l'amplificazione dell'allele normale (fino a 35 CTG) e dell'allele espanso (pi� di 35 CTG). Nel campione sano mi risulta solo l'amplificazione degli alleli normali (che possono differire per numero di CTG da 5 a 35 ripetizioni).

Nelle ultime sedute ho questo problema: oltre ai due alleli normali (che riesco a visualizzare con un gel fortemente concentrato) vedo altre bande, di peso maggiore ma di intensit� minore.

Escludendo un problema di inquinamento tra campioni (DNA riestratti dall'aliquota di sangue originale e pulizie varie, controllo bianco di reazione pulito), dove pu� stare il problema secondo voi?

Pu� essere un problema di mix di reazione (� cambiato il lotto nelle ultime sedute venute male)?