determinazione carica netta di un dipeptide

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antonellamadl
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1 Messaggi

Inserito il - 20 luglio 2016 : 17:33:32

ciao a tutti! ho dei dubbi su come determinare la carica netta dei dipeptidi. io ho capito questo ma non sono sicura che sia corretto:
generalmente il -COOH di un amminoacido ha pk2 mentre NH2 � 9 o 10. quando il pH> pka l'aminoacido si deprotona mentre si protona con pH<pka. � giusto? e se s� come faccio ad applicarlo per i dipeptidi?
Ad esempio come devo disegnare questi:
1-Aspartil-istidina a pH 1 e pH 2

2-Istidilserina pH2

3-Istidil-lisina pH13

AxelHawke
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 18 agosto 2016 : 18:40:44

Devi guardare le pka dei singoli gruppi laterali per ogni amminoacido che sia ionizzabile. Quindi disegni i dipeptidi considerando appunto le pka dei terminali C e N per prime che sono pi� facili, poi confronti le pka degli R con il pH.
Quindi per il primo hai che Asp � 3.86 mentre His � 6. A pH 1 e 2 il dipeptide � totalmente protonato.