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Autore

Discussione

federicaR
Nuovo Arrivato

4 Messaggi

Inserito il - 12 giugno 2017 : 15:08:52

Salve a tutti,
so gi� che questo topic � molto gettonato. Tuttavia il mio quesito � leggermente diverso. Cio�, io analizzo la mia espressione genica utilizzando il Dct ed il DDct. Ottengo quindi una serie di cicli del mio gene X, normalizzato con l'housekeeping.

Quando poi faccio l'istogramma: supponiamo che io abbia l'HK con un Dct 16 (media tra i replicati) e il Dct del mio X 13.

Significa che ne ho meno del mio gene X?

Grazie in anticipo

Caffey
Utente Attivo

Citt�: Perugia

1496 Messaggi

Inserito il - 12 giugno 2017 : 20:03:20

Ciao. C'� qualcosa che mi sfugge... Il deltaCT del tuo HK � per definizione zero. Non ha senso. Parli per caso di CT?
In tal caso il tuo delta CT � negativo, certo, -3. Non significa che hai una quantit� negativa ma che la quantit� del tuo gene � maggiore rispetto a quella dell'HK che hai scelto.
Nessuno ti vieta di mettere questo valore in un grafico ma � pi� difficile da capire perch� inverso (pi� basso � il valore, maggiore � la quantit� di trascritto), logaritmico (3 cicli di differenza sono una quantit� 8 volte maggiore) e talvolte anche negativo! Per tale ragione conviene "trasformare" il tutto in scala lineare esprimendo il valore come 2^-deltaCT (o in caso 2^-delta deltaCT, in base alle necessit�).