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Autore

Discussione

Serena F.
Nuovo Arrivato

Prov.: To
Città: Alpignano

1 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2011 : 11:02:17

Ciao! Sono nuova del forum, e ho già un problema (probabilmente banalissimo) che mi assilla: non so fare i calcoli teorici per la PCR.
Per esempio,in un problemino del genere:

Immaginiamo di avere in provetta 100 copie di un frammento di DNA lineare lungo 2500 bp, e di eseguire una PCR per amplificare un bersaglio di lunghezza 500 bp posto a metà del frammento stesso.

Dopo 5 cicli di PCR, quante molecole di lunghezza = 2500bp ci saranno ?

e quante molecole di lunghezza 1500bp ?

Grazie per l'aiuto!

Hank
Nuovo Arrivato

1 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2011 : 12:05:36

Ciao Serena
secondo i miei calcoli dovresti avere 1 sola copia da 2500bp (quella iniziale che non viene amplificata per intero).
Alla fine del primo ciclo di reazione dovresti avere una copia da 2500 e una da 1500 (complementare alla prima). In seguito avrai solo copie da 1500 che raddoppiano ad ogni ciclo, quindi 2 elevato 4 (cicli rimanenti)= 32 a cui devi sotrarre 1 (che e' il template da 2500)=31 molecole. Spero...

GFPina
Moderatore

Città: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2011 : 17:34:22

Citazione:
Messaggio inserito da Hank

Ciao Serena
secondo i miei calcoli dovresti avere 1 sola copia da 2500bp (quella iniziale che non viene amplificata per intero).

No se parti da 100 molecole non ne puoi avere solo 1!