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DafneAsr
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3 Messaggi

Inserito il - 20 maggio 2012 : 12:00:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DafneAsr Invia a DafneAsr un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,sto studiando per l'esame di genetica e sto consultando il sito per gli esercizi. Vorrei complimentarmi con chi lo gestisce perchè è davvero molto utile!!
In ogni caso, tra i vari esercizi relativi alle distanze di mappa,ne ho trovato uno di cui però non vi era la soluzione; o meglio era stata spostata e non essendo pratica ancora del sito non sono riuscita a ritrovarlo! Ho comunque provato a risolverlo.
L'esercizio è :

viene fatto un icrocio tra un topo eterozigote per i geni r,m,e ed un omozigote recessivoper i tre geni.
Di seguito si riporta la progenie ottenuta:
Fenotipo   Progenie
+++         178
rem         171   
+e+         8
r+m         5
me+         418
++r         433
m++         33
+er         39


determinare ordine dei tre geni e distanze di mappa
calcolare coincidenza e interferenza.

Come prima cosa ho rilevato i parentali(che sono la classe più abbondante) e i doppi ricombinanti (quella meno abbondante). Perciò per i parentali avrò
m e +
+ + r
mentre i doppi ricombinanti
+ e +
r + m

Per stabilire il corretto ordine tra i geni,confronto parentali e DR e deduco che il gene che cambia è " m ". Perciò,l'ordine corretto sarà
e m +
+ + r
A questo punto mi vado a trovare i ricombinanti nella 1 regione e nella 2 regione,mediante disegno che qui però non so come inserire e mi trovo che

Ricombinanti    m + +              Ricombinanti     + + +
regione 1       + e r              regione 2        r e m



Calcolo a questo punto le distanze

distanza tra E-M= Ricombinanti regione1+DR / Totale * 100
quindi 33+39+8+5/1285 * 100 =0.07*100 =6.62 %

Distanza M-R = ricombinanti regione 2 + DR/ totale *100
quindi 178+171+8+5/1285*100= 0.28*100= 28.17%

A questo punto per calcolarmi coincidenza e interferenza, so che
CC= Ricombinanti osservati/ attesi. perciò

Osservati= DR/TOT= 8+5/1285 = 0.010

Ricomb.Attesi= ricombinanti regione1/tot * ricomb regione2/tot=
33+39/1285 * 178+171/1285 = 0.05*0.27= 0.0135

CC= osservati/attesi = 0.010/0.0135 = 0.740

I= 1 - CC= 1-0.740 = 0.26.

Io l'ho risolto cosi; vorrei sapere se è corretto o se ci sono degli errori!!! Grazie mille.

Luss1908
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49 Messaggi

Inserito il - 20 maggio 2012 : 14:46:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Luss1908 Invia a Luss1908 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao! Allora l'ordine dei geni è giusto, la distanza e-m è di 6,6 um, quella m-r è di 28,17 um e quella e-r è di 34,78 um. Per calcolare il coefficiente di coincidenza si divide il numero dei doppi ricombinanti osservati per il numero di quelli attesi. I doppi ricombinanti attesi si calcolano moltiplicando la frequenza di ricombinazione e-m per la frequenza di ricombinazione m-r per il numero totale della progenie dell'incrocio, quindi 0,066 x 0,2817 x 1285 = 23,9. Coeff di coincidenza = (8+5)/23,9 = 0,54. L'interferenza sarà 1- 0,54 = 0,46.
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