Ciao a tutti, ho un dubbio riguardo la Genome-Wide: Mettiamo il caso che io abbia una malattia X (legata ad esposizione ambientale), che condivide alcune caratteristiche con un'altra malattia Y (meno legata a fattori ambientali); vorrei ricercare dei loci di sucettibilità alla malattia X che ipotizzo anche poter essere quelli che danno una maggiore suscettibilità all'influenza ambientale, per fare ciò uso: 1) gruppo con malattia X vs. popolazione di controllo rappresentata da gruppo con malattia Y; o 2) gruppo con malattia X vs. popolazione di controllo rappresentata da gruppo con malattia Y e gruppo di persone esposte al fattore ambientale ma senza alcun segno di alcuna malattia (questo gruppo di sani rappreserebbe infatti quello che penso non venga influenzato per niente dall'esposizione)
La mia domanda è la 2) si può fare? Si possono cioè prendere due diverse popolazioni come un'unica popolazione di confronto? Cioè a me servirebbe sia avere degli eventuali SNPs che differenziano X e Y (e che quindi dovrebbero essere legati a rx all'ambiente), sia quelli che stanno alla base della maggiore influenza all'esposizioe ambientale (X) rispetto a quella dove invece la responsività all'ambiente è minima (sani).