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Lisa.ody
Nuovo Arrivato
43 Messaggi |
 Inserito il - 06 dicembre 2007 : 11:00:08
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devo risolvere questo esercizio ma ho bisogno di una mano. scrivo la traccia:
avete a disposizione un ceppo Hfr prototrofo str(R) (streptomicina resistente) e un ceppo F- amp(R) (ampicillina resistente) auxotrofo che richiede leucina (leu), arginina (arg), lisina (lys), purina (pur) e biotina (bio).
1) disegnate una strategia per determinare velocemente quale gene (leu+,arg+,lys+,pur+ o bio+) è più vicino all'origine di replicazione del fattore F.
2)anche se il ceppo Hfr è mischiato al ceppo F- per lungo tempo, la streptomicina-resistenza non viene trasferita. formulate due diverse ipotesi per spiegare questo risultato.
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tommasomoro
Utente Junior
358 Messaggi |
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tommasomoro
Utente Junior
358 Messaggi |
Inserito il - 06 dicembre 2007 : 18:30:56
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leggi qui
http://jb.asm.org/cgi/reprint/JB.00690-07v1
i genomi batterici li sequenziano 8 alla volta
in qualche settimana
siamo nel 2007 e voi perdete ancora tempo con la storia
T.
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 06 dicembre 2007 : 20:40:29
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Immagino che sia un esercizio di un corso di genetica... non credo lisa voglia fare questa cosa davvero....
Ad ogni modo queste cose non me le ricordo più! 
Qualcuno che lavora con batteriacci e lieviti ci può rinfrescare le idee??? |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
Inserito il - 06 dicembre 2007 : 21:22:56
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Citazione:
Messaggio inserito da chick80
Qualcuno che lavora con batteriacci e lieviti ci può rinfrescare le idee???
Io non lavoro con queste schifezze ...però ci provo...mal che vada ho detto cose che sapete già...
I ceppi Hfr hanno nel genoma il gene F che gli permette di trasferire tutto il genoma ai batteri F-.
Il filamento (genomico) di Dna passa dal batterio Hfr a quello F- in ordine: prima passa l'origine di replicazione, seguito mano mano dai geni più vicini fino ai geni più lontani(per ultimi). Siccome il genoma di un batterio è molto lungo, spesso la coniugazione termina prima che sia stato trasferito completamente al batterio ricevente.
Allora:
faccio avvenire la coniugazione, poi preparo delle piastre con tutti i nutrienti, meno uno che serve all'auxotrofo, quindi 1 tutti tranne leu, un altro tutti tranne arg e così via...
Ipotizziamo che l'ordine dei geni sia questo:
(origine di trasferimento)*---leu---arg---lys---pur---bio---
Allora il gene leu si trasferirà molto, quindi sulla piastra senza leu ci saranno (ad es.) 20 colonie...
il gene arg un po' meno quindi sulla piastra senza arg 15 colonie...
il gene lys ancora meno quindi sulla piastra senza lys 10 colonie...
e così via.
Quindi dal numero di colonie puoi ricavare l'ordine dei geni.
Per quando riguarda la seconda domanda, può essere perchè:
1.il gene di resistenza alla streptomicina è alla fine del genoma, quindi non riesce praticamente mai a trasferirsi
2. il gene è presente in un plasmide, quindi non si trasferisce col genoma...
che ne pensate?!? |
Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato... |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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Marco De Giorgi
Nuovo Arrivato
Prov.: Lecce
Città: Monteroni di Lecce
55 Messaggi |
Inserito il - 07 dicembre 2007 : 13:02:46
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Concordo con domi84.
Si realizza un esperimento di coniugazione interrotta.Cioè dopo un tot di minuti (ad es. 10) si prende una aliquota dalla piastra in cui avviene il trasferimento batterico,si centrifuga per rompere i ponti citoplasmatici e si piastra su diverse piastre contenenti TC meno l'amminoacido verso cui si deve selezionare e con ampicillina per recuperare solo batteri F- ( piastra 1 = TC - leu + amp;piastra 2 = TC - arg + amp;piastra 3 = TC - lys + amp;piastra 4 = TC - pur + amp;piastra 5 = TC - bio + amp.) Se hai crescita solo in una piastra (ad es. piastra 1 = TC - leu + amp) o più colonie in una piastra rispetto alle altre significa che il gene per l' AA mancante nella piastra è stato trasferito per primo e ha subito ricombinazione. Per determinare l'ordine di trasferimento degli altri geni si ripete l'operazione interrompendo la coniugazione dopo più di 10 minuti (ad esempio 15 poi 20...) e si piastra su piastre contenenti TC meno gli AA i cui geni sono stati già trasferiti e meno l'amminoacido verso cui si vuole selezionare e sempre con ampicillina. Alla fine otterrai l'ordine dei geni e la distanza espressa in minuti di trasferimento. Per la seconda domanda concordo pienamente con domi 84. |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
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tommasomoro
Utente Junior
358 Messaggi |
Inserito il - 10 dicembre 2007 : 14:35:00
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e' bello studiare storia della genetica molecolare!!!!
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 10 dicembre 2007 : 21:38:48
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| è bello cercare aiuto e trovare gente simpatica !!!! |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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Lisa.ody
Nuovo Arrivato
43 Messaggi |
Inserito il - 13 dicembre 2007 : 14:39:46
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| grazie mille per tutte le risposte! ;) |
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