Sequenziamento Genoma Umano (dubbi!)

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Inserito il - 21 giugno 2009 : 16:46:50

Ciao a tutti!

Sto studiando i metodi che sono stati utilizzati per studiare il sequenziamento del genoma umano, tuttavia faccio fatica a trovare informazioni chiare sia sui libri che su internet. Ho capito che i metodi che fuorno utilizzati dallo Human Genome Consortium e dall'azienda Celera sono diversi...ma non sono sicura di aver compreso per bene il tutto. Quello che ho capito � che:

Metodo Human Menome Consortium: prevede la costruzione di una libreria gnomica costituita da frammenti BAC che possono contenere frammenti di DNA di circa 50-200 kb. Successivamente si procede costruendo una mappa fisica del genoma: per fare ci� vengono utilizzati dei marcatori per ogni cromosoma (generalmente si utilizzano le STR oppure gli RFLP o ancora gli SNP). A questo punto i cloni vengono sovrapposti a dare sequenze contigue dette contig. in ultimo si fa il sequenziamento shotgun dei cloni e si compie un ultimo assemblaggio dei vari contig per ottenere la sequenza finale

Metodo Celera: prevede la costruzione di una libreria gnomica con frammenti di circa 1.5-10 Kb, successivamente si passa al sequenziamento shotgun cauale dei cloni e infine si ha l�assemblaggio tramite l�utlizzo di appositi software. Questo metodo, sebbene pi� veloce del precedente, presenta un notevole problema: l�assemblaggio delle sequenze pu� risultare parecchio scorretto a causa delle sequenze ripetute che sono molto presenti nei genomi degli organismi eucariotici come l�uomo. Per ovviare a questo problema si usa il metodo del sequenziamento delle estremit� accoppiate: si sequenziano le estremit� di frammenti cromosomici molto ampi in modo tale che se, per esempio, queste estremit� si allineano con il contig X e con il contig Y allora � molto probabile che i due contig derivino dalla stessa regione cromosomica.

E' corretto quello che ho scritto oppure ci sono errori?

Vi ringrazio in anticipo per l'aiuto!