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AccettoreQ
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio nell'Emilia
Città: Reggio Emilia
57 Messaggi |
 Inserito il - 07 dicembre 2018 : 23:16:38
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Salve,
apro questa discussione per chiedere alcuni chiarimenti in merito alla sequenza RBS.
Il docente in aula ha affermato che la sequenza RBS è situata tra il promotore e l'inizio del gene (ATG), ed ha lo scopo di permettere il corretto legame della subunità 16S dell'rRNA in fase di traduzione dell'mRNA a proteina.
Se però la trascrizione avviene solo a partire dall'ATG iniziale allora non comprende la sequenza RBS, e quindi come può questa agire sul legame dell'mRNA sul ribosoma, quando non è presente sull'mRNA?
O forse ho capito male io e la sequenza RBS è parte dell'mRNA?
Vi ringrazio per l'aiuto.
Un caloroso saluto.
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"Non esiste un gene per il destino"
dal film "Gattaca. La porta dell'universo" |
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 08 dicembre 2018 : 12:25:26
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| La trascrizione NON inizia a partire dall'ATG, né nei batteri e tantomeno negli eucarioti. Parte invece dal TSS (transcription start site), che è molto più variabile, soprattutto negli eucarioti, ed è difficile da predire a livello del singolo nucleotide senza dati sperimentali. Il RBS fa parte del trascritto quindi. |
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AccettoreQ
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio nell'Emilia
Città: Reggio Emilia
57 Messaggi |
Inserito il - 09 dicembre 2018 : 19:16:01
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Citazione:
Messaggio inserito da Geeko
La trascrizione NON inizia a partire dall'ATG, né nei batteri e tantomeno negli eucarioti. Parte invece dal TSS (transcription start site), che è molto più variabile, soprattutto negli eucarioti, ed è difficile da predire a livello del singolo nucleotide senza dati sperimentali. Il RBS fa parte del trascritto quindi.
Ciao, ti ringrazio per la risposta. Perfetto, quindi era un errore dovuto alle mie carenze in materia.
Pur essendo difficile da identificare, si sa se questo TSS è situato prima o dopo il promotore? |
"Non esiste un gene per il destino"
dal film "Gattaca. La porta dell'universo" |
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 11 dicembre 2018 : 00:08:05
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| I promotori sono oggetti piuttosto complicati ed è difficile definire i "limiti" di un promotore. Negli eucarioti di solito una breve regione detta "core promoter" di lunghezza variabile (circa 100bp) include il TSS ed è quella riconosciuta e legata dai fattori generali di trascrizione e dalla RNA polimerasi. Sebbene il TSS risulti incluso nel promotore, la maggior parte dei motivi di riconoscimento dei fattori trascrizionali specifici si trovano a monte del TSS. |
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AccettoreQ
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio nell'Emilia
Città: Reggio Emilia
57 Messaggi |
Inserito il - 11 dicembre 2018 : 10:30:09
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Citazione:
Messaggio inserito da Geeko
I promotori sono oggetti piuttosto complicati ed è difficile definire i "limiti" di un promotore. Negli eucarioti di solito una breve regione detta "core promoter" di lunghezza variabile (circa 100bp) include il TSS ed è quella riconosciuta e legata dai fattori generali di trascrizione e dalla RNA polimerasi. Sebbene il TSS risulti incluso nel promotore, la maggior parte dei motivi di riconoscimento dei fattori trascrizionali specifici si trovano a monte del TSS.
Il promotore io lo intendevo come l'insieme di box -10 e box -35.
Ti ringrazio per il chiarimento! |
"Non esiste un gene per il destino"
dal film "Gattaca. La porta dell'universo" |
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 11 dicembre 2018 : 23:37:58
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| Infatti ho specificato negli eucarioti. Nei procarioti (non sono un esperto delle ultime ricerche del settore) il promotore è molto più definito e ristretto in dimensioni come dicevi tu. Nei procarioti si può affermare che il TSS è appena a valle del promotore (sempre che non si considerino le sequenze operatore come parte del promotore). |
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RBS: presenza sull'
