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bree
Utente Junior
186 Messaggi |
 Inserito il - 21 maggio 2011 : 12:50:20
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se devo disegnare un peptide, mettiamo un pentapeptide, in cui la prolina è il terzo aminoacido..come faccio? nel senso: credo che l'N della prolina coinvolto nel legame peptidico lega il C-term dell'aminoacido precedente; contemporaneamente l'N non lega un H (come accade normalmente), ma solo l'ultimo CH" dell'anello che forma la catena laterale di prolina..è giusto? mi basta anche un si o un no!
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 14:19:02
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| Giusto, l'azoto della catena principale contrae un legame con il Carbossilato dell'aa successivo, mentre è già impegnato a chiudere l'anello, manca perciò di un idrogeno e non può, una volta nel peptide, fungere più da donatore di legame idrogeno. Questa è anche la ragione per cui spesso si trovano residui di Pro all'inizio od alla fine di un'alfa-elica: perché tale aa non può essere coinvolto nel caratteristico network di legami idrogeno formante la struttura secondaria. |
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 14:22:28
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inoltre vanno scritti rispettando la stereochimica S  |
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 14:25:37
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| E a differenza di tutti gli altri aminoacidi potresti disegnare il legame peptidico anche in cis, se proprio vogliamo essere esaurienti |
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A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 14:36:20
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| asp in cis rispettoa cosa? |
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 15:08:00
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| Il legame peptidico formato dalla prolina. Tra l'1% e il 10% delle proline formano un legame peptidico in cis rispetto al prosieguo della catena. |
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A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 15:37:20
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ok  |
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bree
Utente Junior
186 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2011 : 15:37:27
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| grazie mille..quella cosa della catena alfa è illuminante tra l'altro, non me ne scordo più :) |
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bruny86
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2014 : 15:27:40
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Salve ragazzi,
la precedente discussione mi é stata molto utile a chiarire un dubbio che avevo.Ora però ne avrei un altro riguardante la possibilità della prolina di instaurare legami IDROGENO.Ad esempio, una delle domande dello scritto di biochimica era disegnare il legame H tra istidina e prolina. So che il legame H si instaura tra l'N del gruppo imidazolico dell' Hys e l'H del gruppo amminico della Pro. La domanda é la seguente: la prolina devo disegnarla nella forma neutra ( NH) o protonata (NH2+)?Grazie a chiunque mi risponderà. |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 21 maggio 2014 : 16:03:02
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A dirla proprio tutta la prolina la si potrebbe disegnare sia in cis che in trans, e non ci si sbaglierebbe troppo.
L'isomeria cis/trans (mediata enzimaticamente post-traduzione, ovvio) delle proline è molto diffusa, soprattutto nelle immunoglobuline. |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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