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 comparare cell lines con qpcr
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d.goldy
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Inserito il - 19 maggio 2012 : 16:15:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di d.goldy Invia a d.goldy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,

ho fatto delle real time pcr con cDNA "estratto" dal 5 linee cellulari per scegliere quale esprimeva di più il mio il gene d'interesse (goi) ed ora le sto analizzando.
Le cell erano:
di ratto, H9C2, RBL
di topo, HL-1 e J774
umane, HeLa.
Ho usato primers per il goi e per GapdH diversi per ogni specie, quindi 6 paia di primers.
Ora penso che però non posso paragonare #8710;Ct per specie diverse in quanto i primers sono diversi e l'espressione di GapdH non è detto che sia uguale per linee cellulare diverse, che ne dite, ho ragione?.
Per esempio posso dire che H9C2 praticamente non esprime il mio gene perchè il Ct è molto vicino al NTC (not template control)?
Voi cosa ne pensate? si può dire qualcosa di scientifico con i dati che ho?

Grazie a tutti
Dana
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