Ciao, ho bisogno del vostro aiuto. Sto cercando di mettere a punto una real time-pcr, ma senza successo. Avrei due 'grandi' quesiti da porvi: 1.quanto RNA retrotrascrete a cDNA e quanto cDNA usate nella real time? Io ho retrotrascritto 100ng di RNA: forse è poco! 2.usando il sybergreen, quali temperature di annealing e extention usereste (i primers hanno TM tra 60-62¤C)? Io ho usato protocollo descritto nella brochure del sybergreen, ovvero real time bifasica: 95¤C denaturazione e 62¤C annealing. Spero qualcuno possa aiutarmi.. non ne esco più! Grazie
Ciao! in genere io ho sempre retrotrascritto 1000ng se ne avevo ovviamente.. altrimenti fino ad un minimo di 400ng.. i cicli che noi utilizziamo sono questi: - 2 minuti a 50°C; - 10 minuti a 95°C; - 15 secondi a 95°C, per 45 cicli; - 1 minuto a 60°C. spero di esserti stata di aiuto!