Sequenziamento Sanger mtDNA

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Jayjay
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9 Messaggi

Inserito il - 18 luglio 2015 : 10:47:51

Ciao,

Ho un problemino a capire una cosa. Sto studiando un articolo sull'utilizzo dell' MPS per sequenziare tratti del DNA mitocondriale al posto del sequenziamento di Sanger.
In pratica le MPS sono meglio perch� riescono a sequenziare le length heteroplasmy di omopolimeri, ci� che con il metodo Sanger non si riesce a fare molto bene o del tutto.
Ma perch�? Vi scrivo le frasi in inglese anche perch� traducendole si capisce ancora meno.
"STS of mtDNA cannot readily sequence regions of amplicons downstream of length heteroplasmy homopolymers. The downstream sequence is uninterpretable due to multiple length molecules being sequenced simultaneously."
e poi riguardo alle MPS invece "MPS was able to sequence and provide interpretable data in a homopolymer C stretch in HVI of sample 400. This homopolymer stretch was unresolvable by STS due to legth heteroplasmy"

Da quello che ho capito nella regione ipervariabile I del DNA mitocondriale c'� questa regione in cui ci sono tante C messe in sequenza (alla fine ce ne sono di 4 tipi diversi, da 10 C, da 11, da 12 C e da 4 A + 11C) e con Sanger non si riesce a sequenziarle...ma perch�? Sopra dice "due to multiple length molecules being sequenced simultaneously...
E cosa fa di diverso la MPS che riesce a sequenziarle?

Se qualcuno riuscisse a spiegarmi sta cosa, gliene sarei molto grata.