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Discussione |
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Alseide
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
 Inserito il - 07 dicembre 2008 : 21:09:03
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CIAO RAGAZZI VORREI AVERE DELLA DRITTE PER COME SI PROGETTANO DEI PRIMER..NON INTENDO A LIVELLO TEORICO MA PRATICO..AD ESEMPIO DEVO DISEGNARE DEI PRIMER PER UNA SEQUENZA AAATGGGCAA: COME FACCIO? QUANTI NE POSSO COSTRUIRE? GRAZIE MILLE PER IL VOSTRO AIUTO! CIAO
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chick80
Moderatore
Cittā: Edinburgh
11491 Messaggi |
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Alseide
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
Inserito il - 08 dicembre 2008 : 11:32:48
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lo so che č troppo corta...č solo un esempio..vorrei sapere,ammettendo che questa č LA SEQUENZA SU CUI VADO A DISEGNARE I miei primer,qaunti ne posso disegnare e come si disegnano non usando dei programmi on line ma a mano!GRAZIE! |
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chick80
Moderatore
Cittā: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 08 dicembre 2008 : 13:55:46
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Citazione:
ammettendo che questa č LA SEQUENZA SU CUI VADO A DISEGNARE I miei primer,qaunti ne posso disegnare
Ribadisco, non ha senso disegnare dei primers su quella sequenza, perchč un singolo primer č in media di 15-20 basi.
Dai un occhio qui per la teoria: http://www.mcb.uct.ac.za/pcroptim.htm
Conta che comunque disegnare i primers a mano non č molto utile in quanto probabilmente ti porterebbe a primers poco efficienti. Inoltre alcune cose non possono essere fatte a mano (es. il controllo che i tuoi primers non vadano su altre sequenze), servono necessariamente dei software. E visto che ci sono, perchč non usarli?
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Laracroftit
Nuovo Arrivato
Cittā: Sassari
37 Messaggi |
Inserito il - 09 dicembre 2008 : 18:32:49
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Ciao!
ma per quanto riguarda il disegno di primers per RT-PCR la prassi č la stessa?
Devo disegnarli entro questa settimana e non so da che parte cominciare....
Grazie! |
"I want to know God's thoughts...
...the rest are details."
(Albert Einstein) |
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chick80
Moderatore
Cittā: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 09 dicembre 2008 : 18:34:21
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Prima di iniziare lunghe spiegazioni... con RT intendi realtime? (E' meglio indicarla con Q-PCR, RT-PCR indica retrotrascrizione+PCR).
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GFPina
Moderatore
Cittā: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 09 dicembre 2008 : 19:07:06
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Comunque in entrambi i casi (real-time o retrotrascrizione) se cerchi nel forum ci sono delle discussioni al riguardo!
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Alseide
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
Inserito il - 10 dicembre 2008 : 22:44:17
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| grazie per le vostre spiegazioni,ho trovato tante notizie utili!! a presto |
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Laracroftit
Nuovo Arrivato
Cittā: Sassari
37 Messaggi |
Inserito il - 11 dicembre 2008 : 15:29:06
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Intendevo retrotrascrizione+PCR (RT-PCR semiquantitativa)..
scusate, in effetti nn era chiaro.. |
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(Albert Einstein) |
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chick80
Moderatore
Cittā: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 11 dicembre 2008 : 15:58:00
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| Allora č esattamente lo stesso procedimento. Una volta fatta la RT hai del DNA, quindi č come una PCR normale. |
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