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abome88
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38 Messaggi

Inserito il - 04 gennaio 2009 : 11:55:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di abome88 Invia a abome88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi volevo porvi qst quesito
Dopo aver selezionato 8 mutanti try- si stabilisca il loro ordine rispetto ai marcatori esterni met e arg eseguendo un paio di incroci reciproci per ogni coppia di mutanti try:
incrocio A: Hfr met- try-(x)try+(y)arg+ X F- met+ try+(x)try-(y)arg-
incrocio B: Hfr met- try+(x)try-(y)arg+ X F- met+ try(x)try(+)arg-
In tutti i casi vengono selezionati prototrofi per piastramento su terreno minimo. Il numero di colonie nei 2 incroci per ogni coppia di mutanti è stato il seguente:

 x  Y Incrocio A Incrocio B  x  y Incrocio A Incrocio B
 1  2  173         27        1  8  226         40
 1  3  156         34        2  3  24          187
 1  4  46          218       2  8  153         17
 1  5  30          197       3  6  20          175
 1  6  168         32        4  5  205         17
 1  7  37          215       5  7  199         34

Determinare l'ordine relativo ai mutanti.
Allora la prof ha detto che nell'incrocio A ci sono 2 crossing over e quindi il numero di colonie saranno molte mentre nell'incrocio B ci sono 4 crossing over e quindi il numero di colonie saranno poche. I miei dubbi sono:
1)Come ha fatto a dire quanti crossing over ci sono?Non riesco proprio a vedere in quali punti ci sono
2) Perchè con 2 crossing over ci sono molte colonie e con 4 invece pochi?
Grazie mille a tutti!
Ciao

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 04 gennaio 2009 : 13:55:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho riformattato il messaggio, così ora la tabella è più comprensibile.

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abome88
Nuovo Arrivato



38 Messaggi

Inserito il - 04 gennaio 2009 : 20:22:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di abome88 Invia a abome88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ah ok grazie mille...cmq ritornando alla genetica, puoi spiegarmi quei dubbi che ho descritto nel messaggio?Grazie ancora...
Citazione:
Messaggio inserito da chick80

Ho riformattato il messaggio, così ora la tabella è più comprensibile.

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 04 gennaio 2009 : 22:34:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Innanzitutto una domanda (è una mia curiosità) ma sei sicura che fosse try? Dovrebbe essere trp (che sta per Triptofano), te lo chiedo perchè è la seconda volta che lo trovo scritto qua in un esercizio... non so se la prof sia la stessa.

Comunque tornando all'esercizio e ai tuoi dubbi!

Citazione:
Messaggio inserito da abome88

2) Perchè con 2 crossing over ci sono molte colonie e con 4 invece pochi?

Perchè l'evento in cui ci sono 4 c.o. è più raro dell'evento in cui ce ne sono solo 2! Quindi evento più raro= meno colonie, evento meno raro= più colonie!
Citazione:
Messaggio inserito da abome88

1)Come ha fatto a dire quanti crossing over ci sono?Non riesco proprio a vedere in quali punti ci sono


Citazione:
Messaggio inserito da abome88

Allora la prof ha detto che nell'incrocio A ci sono 2 crossing over e quindi il numero di colonie saranno molte mentre nell'incrocio B ci sono 4 crossing over e quindi il numero di colonie saranno poche.


Questi sono i crossing ver che avvengono:

Incrocio A: Hfr met- try-(x)try+(y)arg+ X F- met+ try+(x)try-(y)arg-

Hfr     met-    try-(x)    try+(y)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(x)    try-(y)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(x)    try+(y)   arg+

Incrocio B: Hfr met- try+(x)try-(y)arg+ X F- met+ try-(x)try+(y)arg-

Hfr     met-    try+(x)    try-(y)   arg+    
             X          X         X        X    ---> ho 4 c.o.
F-      met+    try-(x)    try+(y)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(x)    try+(y)   arg+


Ma non in tutti i casi l'incrocio A e B saranno così!
Devi basarti sul fatto che sai che a poche colonie corrispondono 4 c.o. e a tante colonie 2 c.o.
Quind sarà così:

 x  Y Incrocio A                        Incrocio B  
 1  2  173  tante colonie = 2 c.o.       27  poche colonie = 4 c.o.     
 1  3  156  tante colonie = 2 c.o.       34  poche colonie = 4 c.o.     
 1  4   46  poche colonie = 4 c.o.      218  tante colonie = 2 c.o.


Questa è la base per risolvere l'esercizio!
adesso a X e Y sostituisci i numeri:
Incrocio A

Hfr     met-    try-(1)    try+(2)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(1)    try-(2)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(1)    try+(2)   arg+

così va bene, quindi 1 sta prima di 2.
Lo stesso per 1 e 3:
Incrocio A

Hfr     met-    try-(1)    try+(3)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(1)    try-(3)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(1)    try+(3)   arg+

Per 1 e 4 invece hai tante colonie nell'incrocio B quindi sarà quello che ha 2 c.o.:
Incrocio B:
se fosse:

Hfr     met-    try+(1)    try-(4)   arg+    
                                             
F-      met+    try-(1)    try+(4)   arg-


Non basterebbero 2 c.o. per ottenere il prototrofo, quindi è così:
Hfr     met-    try-(4)    try+(1)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(4)    try-(1)   arg-

e ottengo il prototrofo:
met+    try+(4)    try+(1)   arg+

Quindi 4 è prima di 1.

Andando avanti stabilisci tutto l'ordine dei geni!

Spiegare l'esercizio è ben più complicato che risolverlo!


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mara88
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21 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2009 : 17:54:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mara88 Invia a mara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
abome 88 sei di lecce?
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mara88
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21 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2009 : 18:41:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mara88 Invia a mara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
gf pina ,ma poi come si procede..nel senso che la prof chiedeva l' ordine generale....bo io all' esame l' ho fatto, ma nn ho capito l' ultima parte cioè quella che di chiedo...
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mara88
Nuovo Arrivato



21 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2009 : 18:56:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mara88 Invia a mara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
scusate scrivo un' ultima volta e poi basta giuro.....ma l' ordine è per caso: 75416238
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abome88
Nuovo Arrivato



38 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2009 : 19:49:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di abome88 Invia a abome88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao Mara88 sn di Brindisi ma frequento l'università a lecce..tu invece di dove sei?
Citazione:
Messaggio inserito da mara88

abome 88 sei di lecce?

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abome88
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38 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2009 : 19:53:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di abome88 Invia a abome88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao GFPina si sono sicura è try...cmq non voglio essere noiosa però se io provo a fare in entrambi gli incroci i crossing over mi esce che in tutti e 2 ne occorrono solo due per ottenere colonie prototrofe...cioè com'è che nell'incrocio B ne occorrono 4?sicuramente la mia domanda sarà stupida ma giuro non riesco proprio a capire praticamente come ci sono 4 c.o. nell'incrocio B.
Grazie mille di tutta la spiegazione...
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina

Innanzitutto una domanda (è una mia curiosità) ma sei sicura che fosse try? Dovrebbe essere trp (che sta per Triptofano), te lo chiedo perchè è la seconda volta che lo trovo scritto qua in un esercizio... non so se la prof sia la stessa.

Comunque tornando all'esercizio e ai tuoi dubbi!

Citazione:
Messaggio inserito da abome88

2) Perchè con 2 crossing over ci sono molte colonie e con 4 invece pochi?

Perchè l'evento in cui ci sono 4 c.o. è più raro dell'evento in cui ce ne sono solo 2! Quindi evento più raro= meno colonie, evento meno raro= più colonie!
Citazione:
Messaggio inserito da abome88

1)Come ha fatto a dire quanti crossing over ci sono?Non riesco proprio a vedere in quali punti ci sono


Citazione:
Messaggio inserito da abome88

Allora la prof ha detto che nell'incrocio A ci sono 2 crossing over e quindi il numero di colonie saranno molte mentre nell'incrocio B ci sono 4 crossing over e quindi il numero di colonie saranno poche.


Questi sono i crossing ver che avvengono:

Incrocio A: Hfr met- try-(x)try+(y)arg+ X F- met+ try+(x)try-(y)arg-

Hfr     met-    try-(x)    try+(y)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(x)    try-(y)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(x)    try+(y)   arg+

Incrocio B: Hfr met- try+(x)try-(y)arg+ X F- met+ try-(x)try+(y)arg-

Hfr     met-    try+(x)    try-(y)   arg+    
             X          X         X        X    ---> ho 4 c.o.
F-      met+    try-(x)    try+(y)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(x)    try+(y)   arg+


Ma non in tutti i casi l'incrocio A e B saranno così!
Devi basarti sul fatto che sai che a poche colonie corrispondono 4 c.o. e a tante colonie 2 c.o.
Quind sarà così:

 x  Y Incrocio A                        Incrocio B  
 1  2  173  tante colonie = 2 c.o.       27  poche colonie = 4 c.o.     
 1  3  156  tante colonie = 2 c.o.       34  poche colonie = 4 c.o.     
 1  4   46  poche colonie = 4 c.o.      218  tante colonie = 2 c.o.


Questa è la base per risolvere l'esercizio!
adesso a X e Y sostituisci i numeri:
Incrocio A

Hfr     met-    try-(1)    try+(2)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(1)    try-(2)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(1)    try+(2)   arg+

così va bene, quindi 1 sta prima di 2.
Lo stesso per 1 e 3:
Incrocio A

Hfr     met-    try-(1)    try+(3)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(1)    try-(3)   arg-

ottengo:
                                             
         met+    try+(1)    try+(3)   arg+

Per 1 e 4 invece hai tante colonie nell'incrocio B quindi sarà quello che ha 2 c.o.:
Incrocio B:
se fosse:

Hfr     met-    try+(1)    try-(4)   arg+    
                                             
F-      met+    try-(1)    try+(4)   arg-


Non basterebbero 2 c.o. per ottenere il prototrofo, quindi è così:
Hfr     met-    try-(4)    try+(1)   arg+    
                        X                  X    ---> ho 2 c.o.
F-      met+    try+(4)    try-(1)   arg-

e ottengo il prototrofo:
met+    try+(4)    try+(1)   arg+

Quindi 4 è prima di 1.

Andando avanti stabilisci tutto l'ordine dei geni!

Spiegare l'esercizio è ben più complicato che risolverlo!




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GFPina
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GFPina

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Inserito il - 06 gennaio 2009 : 22:38:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora rispondo prima a mara88!

Citazione:
Messaggio inserito da mara88

scusate scrivo un' ultima volta e poi basta giuro.....ma l' ordine è per caso: 75416238

No l'ordine non è giusto! E' giusto che 7, 5 e 4 siano prima di 1 e che 6, 2, 3 e 8 siano dopo, ma per il resto è sbagliato!
Se hai capito il ragionamento di prima dovresti ottenere questi risultati:

 x  Y Incrocio A  Incrocio B     Ordine
 1  2  173           27           1-2
 1  3  156           34           1-3
 1  4  46           218           4-1
 1  5  30           197           5-1
 1  6  168           32           1-6
 1  7  37           215           7-1

x  y Incrocio A  Incrocio B      Ordine
1  8  226            40           1-8
2  3  24            187           3-2
2  8  153            17           2-8
3  6  20            175           6-3
4  5  205            17           4-5
5  7  199            34           5-7

Dopo di che metti tutto assieme:
dai primi due incroci hai: 1-2 e 1-3 (sia 2 che 3 stanno dopo 1)
adesso devi sapere chi sta prima tra 2 e 3, guardi il secondo incrocio della serie sotto (x2 X y3) e vedi che hai: 3-2, quindi 3 sta prima di 2.
L'ordine quindi è: 1-3-2 e vai avanti così fino a stabilire tutto l'ordine.
Alla fine otterrai: 4-5-7-1-6-3-2-8
--------------------------------------------------------------------------------------------------

Risposta per abome88:
Citazione:
Messaggio inserito da abome88

...cmq non voglio essere noiosa però se io provo a fare in entrambi gli incroci i crossing over mi esce che in tutti e 2 ne occorrono solo due per ottenere colonie prototrofe...cioè com'è che nell'incrocio B ne occorrono 4?sicuramente la mia domanda sarà stupida ma giuro non riesco proprio a capire praticamente come ci sono 4 c.o. nell'incrocio B.

Provo a ridisegnarti l'incrocio B:
Incrocio B: Hfr met- try+(x)try-(y)arg+ X F- met+ try-(x)try+(y)arg-
(N.B. per semplificare un po' il disegno scrivo m per met, x, y e a per arg)


Hfr      m-    X+    Y-   a+  
        X   X                    ---> se hai 2 c.o. (uno prima di m e l'altro tra m e X)
F-       m+    X-    Y+   a-
ottieni:

                                  ---> non è prototrofo
        m-    X-    Y+    a-




Hfr      m-    X+    Y-   a+  
             X          X        ---> se hai 2 c.o. (uno tra m e X e l'altro tra Y e a)
F-       m+    X-    Y+   a-
ottieni:

                                  ---> non è prototrofo
        m+    X+    Y-    a-



Hfr      m-    X+    Y-   a+  
                  X     X        ---> se hai 2 c.o. (uno tra X e Y e l'altro tra Y e a)
F-       m+    X-    Y+   a-
ottieni:

                                 ---> non è prototrofo
        m+    X-    Y-    a-




Hfr      m-    X+    Y-   a+  
                  X          X    ---> se hai 2 c.o. (uno tra X e Y e l'altro dopo a)
F-       m+    X-    Y+   a-
ottieni:

                                 ---> non è prototrofo
        m+    X-    Y-    a+


Non so se li ho disegnati tutti i possibili c.o., comunque se invece hai 4 c.o.:

Hfr      m-    X+    Y-   a+  
            X     X     X    X    ---> se hai 4 c.o. (uno tra m e X, uno tra X e Y, uno tra Y e a e l'altro dopo a)
F-       m+    X-    Y+   a-
ottieni:

                                 ---> è l'unico caso in cui è prototrofo
        m+    X+    Y+    a+


Detto in altre parole Hfr deve passare a F- 2 geni (X+ e a+) che sono separati tra loro da un terzo gene (Y-) che non deve invece passare! Quindi l'unico modo per farlo è che ci siano 4 c.o., con 2 sarebbe impossibile!

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mara88
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21 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2009 : 13:04:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mara88 Invia a mara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si abome sono anche io della provincia di Brindisi e frequento a Lecce...se frequenti le lezioni sicuramente ci conosciamo...grazie GFPina adesso ho capito.
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abome88
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38 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2009 : 13:37:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di abome88 Invia a abome88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ah ma dai..che coincidenza...io frequento biotecnologie...allora in bocca al lupo per l'esame e speriamo che ci vada bene..
Cmq GFPina grazie mille mi sei stata utilissima ed ho capito..ciao ciao!
Citazione:
Messaggio inserito da mara88

si abome sono anche io della provincia di Brindisi e frequento a Lecce...se frequenti le lezioni sicuramente ci conosciamo...grazie GFPina adesso ho capito.

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mara88
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21 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2009 : 17:47:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mara88 Invia a mara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
crepi..in bocca al lupo anche a te...anke se per me la vedo brutta!
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ginestra88
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Inserito il - 13 gennaio 2009 : 11:34:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ginestra88 Invia a ginestra88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti!!! sono appena arrivata nel forum!!ho letto alcuni quesiti e le rispettive risposte, mi sono state utili!!! credo quindi possiate aiutarmi a chiarire un pò di dubbi che ho in materia genetica!!!
mi rifaccio all'esercizio qua proposto. dalle risposte ho capito come deve essere svolto, ma non sono sicura di aver compreso alcuni concetti alla base:
1) il processo che avviene è una coniugazione; in questo caso si deve supporre che tutti i geni interessati siano stati trasferiti, giusto?
2) gli otto mutanti try- sono individui caratterizzati dall'avere mutazioni in diversi punti dello stesso gene? per questo si richiede l'ordine rispetto ai geni che codificano per met e arg?
queste domande possono essere benali, ma non sono sicura di aver capito bene. aspetto quindi le vostre risposte... grazie!!!
P.S. scusate l'ignoranza!!!
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GFPina
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GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 13 gennaio 2009 : 23:06:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da ginestra88

1) il processo che avviene è una coniugazione; in questo caso si deve supporre che tutti i geni interessati siano stati trasferiti, giusto?

Non ho voglia di mettermi a fare tutti i disegni, ma diciamo di si, se non passassero non potrebbero ricombinare e non avresti prototrofi, quindi comunque non li vedresti su terreno minimo.

Citazione:
Messaggio inserito da ginestra88

2) gli otto mutanti try- sono individui caratterizzati dall'avere mutazioni in diversi punti dello stesso gene? per questo si richiede l'ordine rispetto ai geni che codificano per met e arg?

Si, ma Yanofsky e la Triptofano sintasi ce li avete nel programma? Perchè in fondo è di quello che si tratta!
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