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ercole
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
 Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:20:31
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salve raga
sono stati determinati i seguenti genotipi del locus B in una popolazione formata da 10000individui. sono stati risultati i seguenti valori BB 99 bb 1799 bb 8002 calcolate le frequenze alleliche e genotipiche di questa popolazione. secondo voi questa popolazione rispetta l'equilibrio hardy weinberg relativamente al locus B?
per primo calcolo le frequenze genotipiche della popolazione rapportando i numeri di individui con un dato genotipo e il numero tot. degli individui
BB 96/10000= 0,001
Bb 1799/10000=0.18
bb 8002/10000=0,89
con la radice quadrata di BB trovo frequenza allelica B, con la radice quadrata del valore b trovo la frequenza allelica di b.
frequenza di B=0,03 frequenza di b=0,94 frequenze di Bb=0.18
non vi è un eqilibrio perche frequenza di Bb dovrebbe essere 2pq=0.06 essendo b=0.94 e B=0.03 0.06
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:24:30
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Citazione:
non vi è un eqilibrio perche frequenza di Bb dovrebbe essere 2pq=0.06 essendo b=0.94 e B=0.03 0.06
E come fai a dire che le differenze che vedi non siano semplicemente casuali? |
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ercole
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:28:55
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| quindi devo effetuare un test del chi quadro tra valori (osservati-attesi) quadro/ attesi solo che gli attesi non so come calcolari forse utilizzando l'equazione p quadro+ 2pq + q quadro |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 19:37:32
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Citazione:
Messaggio inserito da chick80
...(nota:non ho controllato se i calcoli sono corretti)
Li ho controllati io 
Comunque non c'è "niente" di corretto, a partire dai dati dell'esercizio:
Citazione:
Messaggio inserito da ercole
in una popolazione formata da 10000individui. sono stati risultati i seguenti valori BB 99 bb 1799 bb 8002
99 + 1799 + 8002 = 9900 non 10000, mancano 100 individui!!!
Citazione:
Messaggio inserito da ercole
BB 96 99/10000= 0,001 0,01
Bb 1799/10000=0.18
bb 8002/10000= 0,89 0,80
Citazione:
Messaggio inserito da ercole
con la radice quadrata di BB trovo frequenza allelica B, con la radice quadrata del valore b trovo la frequenza allelica di b.
questo lo puoi fare solo se la popolazione è in equilibrio, altrimenti il binomio di HW non vale!
I seguenti conti non hanno senso perché è sbagliato il procedimento, comunque sono sbagliati:
Citazione:
Messaggio inserito da ercole
frequenza di B=0,03 RadQ(0,01)= 0,1
Comunque ricominciando da capo l'esercizio e mettendo dei dati coerenti:
N° individui 10000
BB 199
Bb 1799
bb 8002
Le frequenze alleliche le calcoli direttamente "contando" gli alleli:
fr(B) = N° alleli B/alleli totali
fr(B) = (199*2 + 1799)/20000 = 0,11
(oppure (199 + 1799/2)/10000)
fr(b) = (8002*2 + 1799)/20000 = 0,89
a questo punto la somma delle 2 frequenze alleliche fa 1.
Applichi il binomio di HW per calcolarti le "frequenze genotipiche attese", le "frequenze genotipiche osservate" è giusto calcolarle come hai fatto prima.
Infine come suggeriva chick80 fai un chi quadrato. |
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ercole
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 19:56:07
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(hw) frequenzegenotipiche attese= BB=0.11*0.11=0.0121*10000=121
bb=0.89*0,89=0.7921*10000=7921
Bb=0.89*0.11*2=0.1958*10000=1958
le frequenze attese da inserire nel test del chi quadro sono invece quelle riportate dai dati nell'esercizio |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 20:11:32
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solo una piccola "precisazione" sui termini:
le "frequenze" non sono numeri interi, ma sono le percentuali espresse come 0,...
quindi le frequenze sono:
BB=0.0121
bb=0.7921
Bb=0.1958
Quelli che hai indicato sono il "numero" di individui. |
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ercole
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2009 : 20:48:58
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| scusami allora quelle calcolate sono le frequenze osservate e le frequenze attese come posso calcolarle per eseguire il chi quadro |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2009 : 22:12:34
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Citazione:
Messaggio inserito da ercole
scusami allora quelle calcolate sono le frequenze osservate e le frequenze attese come posso calcolarle per eseguire il chi quadro
Non usi le "frequenze" per il calcolo del chi quadrato ma usi il n° di individui!
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Discussione |
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frequenze genotipiche ed alleliche di una popolazi
