Qualcuno sà dirmi perchè a un certo punto il passaggio protonico fuori dalla matrice contro gradiente cessa e il processo si inverte verso la formazione di ATP?
Non è che cessa. Lo devi vedere come un movimento continuo. La membrana mitocondriale interna ne ha tanti dei complessi della catena respiratoria. Quindi fino a che arrivano i substrati, i complessi I, III e IV continuano a espellere i protoni contro gradiente, così come le pompe ATPasiche continuano di pari passo a reimmetterli all'interno della matrice con produzione di ATP.
Cioè sono accoppiati i due fenomeni ma non è che uno va e uno è fermo e poi l'altro si ferma per far cominciare l'altro. Il gradiente protonico viene mantenuto sempre e sfruttato dalla pompa ATPasica.