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edoardo
Nuovo Arrivato
Prov.: Roma
2 Messaggi |
 Inserito il - 02 marzo 2006 : 15:57:32
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aiuto devo affrontare l'esame di biologia molecolare 2.
il mio docente mi ha dato solo delle dispense esiste un libro che tratti questi argomenti ?
aiutatemi per favore come si fa a preparare un esame su un monitor solo con delle dispense ... posseggo gia il libro biologia molecolare weaver ma non tratta specificamente questi temi.
• Produzione delle estremità 3’ degli mRNA
- La poliadenilazione
- Identificazione sequenze consensus, confronti filogenetici e mutazioni.
- Uso di RNA marcati ed estratti per analizzare il processo in vitro; frazionamento/purificazione fattori
- Subunità che legano l’RNA – analisi della specificità di legame (band shifts/competizioni)
- identificazione per omologia dei geni di lievito, mutanti condizionali e studio della loro funzione (estratti di lievito mutati per singoli componenti)
• Regolazione della formazione delle estremità 3’ degli mRNA:
- poliadenilazione alternativa nei geni delle immunoblobuline
- proteina NS1 del virus dell’influenza –
- controllo autogeno della proteina U1A a livello di poliadenilazione (identificazione siti di legame sul trascritto primario di U1A, uso di estratti per dimostrare che effetto su poliadenilazione e non taglio, mutanti di U1A che legano ma non reprimono, interazione con Pap)
• Produzione dell'estremità 3' degli mRNA per gli istoni – lo snRNA U7
- esperimenti di microiniezioni in oociti di Xenopus di geni per gli istoni di riccio - tentativi di complementazione con proteine/cDNA/poli-A- RNA
- sequenza di U7 e complementarietà con 3’ UTR degli mRNA per gli istoni
- mutazioni su 3’ UTR e soppressione con mutanti in U7 snRNA
• Produzione delle estremità 3’ di piccoli RNA non codificanti
- I precursori degli snRNA non vengono poliadenilati
- Disaccoppiamento tra taglio e poliadenilazione
- Importanza dell’assemblaggio co-trascrizionale per la corretta terminazione/processamento dei trascritti nascenti
• Lo splicing e i piccoli RNA nucleari
- Interazioni RNA/RNA e riarrangiamenti strutturali nella formazione dello “spliceosome” attivo.
- identificazione importanza del 5’ di U1 (mutanti 5’ss e soppressori in U1 - RNasiH) e di U2 in lievito (mutanti in branch site e soppressori in U2)
- cambiamenti conformazionali (U6 su 5’ ss, U5 su esoni)
- interazione U6/U4 e U6/U2 (analisi filogenetica di conservazione di sequenza e coevoluzione U6/U4/U/2
• Regolazione dello splicing alternativo :
- proteina ribosomale L32 in lievito –
- identificazione che la regolazione opera a livello di splicing e che la proteina è l’effettore della regolazione
- identificazione delle sequenze coinvolte nella regolazione (sequenze conservate filogeneticamente, 5’SS non-canonico)
- mutazioni che rilasciano il controllo
- analisi in vitro del legame della proteina sul proprio pre-mRNA e analisi dell’interferenza con lo splicing
• Autosplicing (introni di gruppo I e II)
- Identificazione che il pre-rRNA di T.thermophila è in grado di fare autosplicing
- Intermedi di splicing e richiesta del cofattore guanosinico
- Reazione di transesterificazione
- Identificazione introni gruppo II
- Importanza della presenza degli introni nell’evoluzione dei geni eucariotici (aumento frequenza ricombinazione e funzionalità del prodotto di ricombinazione)
- Geni e genomi senza introni
• Correlazioni evolutive tra splicing nucleare e autosplicing (conservazione domini di interazione snRNA pre-mRNA e domini introni di gruppo II: U2/U6/BS – U5/siti di splicing)
Stabilità dell’RNA
- deadenilazione e decapping,
• mRNA factory
• –accoppiamento tra trascrizione e processi post-trascrizionali (capping, splicing, trasporto e formazione delle extremità 3’)
- esperimenti per verificare che enzimi di capping interagiscono solo con CTD-P (Ippt)
- copurificazione di 160 KD con TFIID
- esperimenti per dimostrare che 160 KD di CPSF interagisce con TFIID e solo dopo l’inizio della trascrizione si associa al CTD-P (Ippt e western)
- CSPF 160 kD non viene reclutata su promotori di istoni
- identificazione di Aly e TAP (importanza per l’esporto) e loro reclutamento durante lo splicing (interazione con UAP 56)
aiuto! vi prego ho bisogno di voi!
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quoth the raven nevermore! |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 02 marzo 2006 : 19:01:54
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Io di biologia molecolare ho il 'Weaver - Molecular Biology' della McGraw-Hill... A occhio e croce ci sono una buona parte di questi argomenti.
Ti conviene studiare sulle review pero'... e' difficile trovare un libro che tratti di tutte queste cose.. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Jarod99
Nuovo Arrivato
78 Messaggi |
Inserito il - 03 marzo 2006 : 19:45:31
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| Io ti consiglio "il Gene VI" ( o comunque l'ultima edizione in italiano) di Lewin. In certi argomenti completa il Weaver. |
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vinta
Nuovo Arrivato
Prov.: Piacenza
Città: Piacenza
81 Messaggi |
Inserito il - 04 marzo 2006 : 01:20:55
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Citazione:
Messaggio inserito da Jarod99
Io ti consiglio "il Gene VI" ( o comunque l'ultima edizione in italiano) di Lewin. In certi argomenti completa il Weaver.
E' uscita da poco la traducione del gene VIII a opera di Zanichelli. |
Young Scientist, yet another science blog
http://yscientist.blogspot.com |
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GfCampione
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
Città: Perugia
36 Messaggi |
Inserito il - 07 marzo 2006 : 18:39:23
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| Prendi il Gene VIII, costa un po' ma c'è davvero tutto.... |
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edoardo
Nuovo Arrivato
Prov.: Roma
2 Messaggi |
Inserito il - 15 marzo 2006 : 21:26:20
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| grazie ragazzi , siete stati fantastici. grazie . |
quoth the raven nevermore! |
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P.M.
Nuovo Arrivato
35 Messaggi |
Inserito il - 20 luglio 2006 : 11:04:31
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| Edoardo cos'è Ippt????ho l'esame domani!!! |
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magronotturno
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
Inserito il - 09 gennaio 2008 : 12:36:49
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Ma... come avere fatto a trovare quegli argomenti sul Gene VIII ??? Bisogna fare quasi tutto sulle review ?? Possibile ??
Ad esempio "Proteina NS1 e blocco di CPSF" sul Lewin dove sta ????? AIUTOOOOOOOOOOO !!!!  |
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Aureus
Utente Junior
Prov.: Forlì-Cesena
Città: Gambettola
123 Messaggi |
Inserito il - 09 gennaio 2008 : 14:24:04
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Prova anche a guardare "Genomi II" se ti scompiffera..
...troverai utili informazioni per la preparazione
T.A.Brown
Ciao ciao |
www.tlbspazio.it
Tecnici di Laboratorio Biomedico
Lorenzo Nardi |
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magronotturno
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
Inserito il - 10 gennaio 2008 : 12:44:09
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Ok, lo sto scaricando.. però sono pessimista, la maggior parte delle review sono a pagamento.. uff..
grazie cmq :) |
Chi vale vola, chi non vale non vola, chi vale e non vola è un vile.. |
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Muster
Nuovo Arrivato
8 Messaggi |
Inserito il - 18 novembre 2008 : 13:27:53
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ragazzi, una domanda da "niubbo" che cosa è una review???
Scusate l'iNNioranza  |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6941 Messaggi |
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Discussione |
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aiuto esame libro di biologia molecolare II
Didattica
