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peppy
Nuovo Arrivato

18 Messaggi

Inserito il - 23 marzo 2009 : 16:47:56

ciao a tutti!!!problema!
per allineare le mie sequenze utilizzo un programma della DNASTAR che si chiama seqman...il punto � che ogni tanto impazzisce e oggi, per esempio, mi mette in un contig differente delle sequenze che invece si dovrebbero allineare in corrispondenza di un esone specifico del mio gene. ho pensato che l'esperimento fosse venuto male, ma se guardo le sequenze singole � tt a posto!!!! qualcuno ha un altro programma da consigliarmi? opp...cosa dovrei fare...tagliare ai lati le sequenze (all'inizio e alla fine i picchi si perdono un po') e poi riallinearle? ma cn quale programma posso tagliarle??!
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA!

~peppy~

crikkia
Nuovo Arrivato

3 Messaggi

Inserito il - 27 marzo 2009 : 12:24:10

Se usi il comando force join contigs dovresti poter allinearle manualmente! E' un po' sbatti, ma come ultima risorsa!