Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 MolecularLab
 Genetica
 linkage
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

Mareluna
Nuovo Arrivato


Prov.: Treviso


16 Messaggi

Inserito il - 11 aprile 2006 : 19:10:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mareluna  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Mareluna Invia a Mareluna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve!! sono nuova della zona quindi innanzitutto CIAO A TUTTI!!
volevo porre un quesito alla comunità: avrei bisogno di qualche informazione riguardo l'identificazione dei geni malattia mediante Genome Wide Search! ok, si amplificano marcatori STR distribuiti casualmente e in modo tale da ricoprire gran parte del genoma al fine di avere un quadro d'insieme, ma dopo come si procede?
In aula ci è stato parlato dell'utilizzo di kit e primer fluorescenti riuniti in pannelli su cui effettuare elettroforesi capillari, ma sinceramente non mi è per nulla chiaro!!
Ho provato a cercare in rete ma l'argomento è talmente vasto che non ho trovato quello che mi interessava!
Qualche suggerimento?

Grazie a tutti!!!

caspita quanti biomolecologi tutti insieme

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2006 : 02:33:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Suppongo ti stessero parlando di pannelli tipo gli ABI PRISM Linkage Mapping Set della Applied Biosystem.

Dal product sheet (PDF)
Linkage Mapping Sets v. 2.5 consist of 811 fluorescent-labeled PCR markers selected to amplify highly informative two base-pair repeat microsatellite loci. These markers are arranged in two sets to provide coverage of the human genome at 5 cM and 10 cM average resolution. The markers are from the 1996 Gènèthon Human genetic map and were selected based on chromosomal location and heterozygosity.

In pratica quindi sono serie di primer fatti per amplificare opportune zone dei vari cromosomi e marcati con differenti fluorofori in modo che si possano analizzare separatamente più prodotti di PCR con l'elettroforesi capillare.

Vedi anche questo:Coupling of optimized multiplex PCR and automated capillary electrophoresis for efficient genome-wide searches

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

Mareluna
Nuovo Arrivato


Prov.: Treviso


16 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2006 : 09:17:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mareluna  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Mareluna Invia a Mareluna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie mille, hai confermato le mie teorie!!alla fine non erano così strampalate come credevo, pensavo peggio

Grazie ancora! ciao ciao
Torna all'inizio della Pagina

DNAfingerprinting
Nuovo Arrivato

Prov.: Pordenone
Città: Fiume Veneto


23 Messaggi

Inserito il - 16 aprile 2006 : 22:14:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DNAfingerprinting Invia a DNAfingerprinting un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
NO.. invece a me nn è kiaro.......... scusate ma una volta ke ho fatto l'elettroforesi capillare ke succede? come lo individuo qesto gene malattia? in base a cosa....
Mi sto confondendo tutto

uff..
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2006 : 06:27:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Questi kit ti permettono di fare un'analisi di linkage. L'elettroforesi capillare ti serve solo per velocizzare ed automatizzare le cose, potresti fare una normale elettroforesi su gel di agarosio.

Da http://en.wikipedia.org/wiki/Linkage_mapping

Linkage mapping is critical for identifying the location of genes that cause genetic diseases. In a normal population, genetic traits and markers will occur in all possible combinations with the frequencies of combinations determined by the frequencies of the individual genes. For example, if alleles A and a occur with frequency 90% and 10%, and alleles B and b at a different genetic locus occur with frequencies 70% and 30%, the frequency of individuals having the combination AB would be 63%, the product of the frequencies of A and B, regardless of how close together the genes are. However, if a mutation in gene B that causes some disease happened recently in a particular subpopulation, it almost always occurs with a particur allele of gene A if the individual in which the mutation occurred had that variant of gene A and there have not been sufficient generations for recombination to happen between them (presumably due to tight linkage on the genetic map). In this case, called linkage disequilibrium, it is possible to search potential markers in the subpopulation and identify which marker the mutation is close to, thus determining the mutation's location on the map and identifying the gene at which the mutation occurred. Once the gene has been identified, it can be targeted to identify ways to mitigate the disease.

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina