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kay30
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20 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:14:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kay30 Invia a kay30 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
devo svolgere questo esercizio, ma non riesco.... quindi la giro a voi: allineare i seguenti elementi sul filamento di DNA dall estremità 5' a 3':
- +1(primo nucleotide trascritto)
- sequenza -35
- ATG codone inizio traduzione
- SD sequenza shine delgarno
- sequenza -10
- T terminazione trascrizione
- TAA codone terminazione traduzione
- O sequenza operatore


help help help

Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:27:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Tu come lo faresti?

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

Less Jim Morrison, more Sean Morrison!


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Neuroscience
Utente



659 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:30:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Neuroscience Invia a Neuroscience un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
se ho capito bene devi scrivere una sequenza del dna del tipo

-5 +1 +20
5'-CTACTACTGTGACTG.....ACGTGTGAC-3'

completo di ATG, SD nella sequenza e sopra ci scrivi +1 e le sequenze a -35 etc etc

se prendi un qualsiasi libro che parla delle sequenze shine delgarno, operone, consensus, promotori, trascrizione sicuramente troverai qualche esempio a cui ispirarti

Provaci almeno no?

n.
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kay30
Nuovo Arrivato



20 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:37:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kay30 Invia a kay30 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
devo solo mettere sul filamento da 5' a 3' gli elementi. secondo me:

5' -35 -10 +1 SD ATG OPERONE TAA T 3'

NON SONO SICURA PENSO DI AVER SCRITTO SCIOCCHEZZE A LIVELLO DI SHINE DALGARNO
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northenstar
Nuovo Arrivato

intellectu

Prov.: Roma
Città: Roma


91 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:40:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di northenstar Invia a northenstar un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
a me sembra ok, Shine Dalgarno è a monte del codone di inizio della traduzione quindi...

Studiando Biologia Molecolare con Matusalemme....

"Bisogna avere in sé il caos per partorire una stella che danzi." nietzsche
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kay30
Nuovo Arrivato



20 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 17:46:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kay30 Invia a kay30 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
OK GRAZIE 1000!!!
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kay30
Nuovo Arrivato



20 Messaggi

Inserito il - 09 ottobre 2009 : 16:22:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kay30 Invia a kay30 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
a distanza di un pò di tempo mi ritrovo sulla stessa domanda... -35 dista 35 basi e va prima seguita da -10----- a questo punto non dovrebbe andare la shine dalgarno x riconoscere il sito di dna?? e poi il primo nucleotite trascritto +1 ATG O TAA T????????????????
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jhonfish
Nuovo Arrivato



4 Messaggi

Inserito il - 13 settembre 2010 : 15:34:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di jhonfish Invia a jhonfish un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Rispondo anche se un po' in ritardo. I siti -35 e -10 sono la sequenza promotore riconosciuta nei batteri dalla subunità sigma che permette in seguito l'attacco della RNApolimerasi. La RNApolimerasi inizierà a trascrivere a partire da +1(primo nucleotide trascritto). All'interno dell'RNA trascritto troveremo la sequenza consenso Shine-Dalgarno, che é un RBS (Ribosome Binding Site) come lo é la sequenza Kozak per gli eucarioti, a cui si legherà il ribosoma per iniziare la traduzione (ma la sequenza consenso Shine-Dalgarno non ha nessuna funzione se in forma di DNA, funziona solo se in forma di RNA perché é complementare alla sequenza 3' terminale del RNA ribosomale 16S). Quindi la sequenza Shine-Dalgarno non può essere prima del +1(primo nucleotide trascritto) altrimenti il ribosoma non saprebbe dove legarsi sull'RNA messaggero.

===promotore======R B S===||||||||| O R F |||||||||==========
..-35.........-10...+1.....SD.......ATG........................TAA....T.....

Per quanto riguarda invece O(l'operatore) che é la sequenza a cui si lega il repressore o l'attivatore specifico della trascrizione, so che può stare a monte o a valle del promotore, ma non so se possa trovarsi all'interno della sequenza tradotta. A naso direi che per gli operoni inducibili positivi e repressibili positivi non può verificarsi perché l'attacco dell'attivatore costituirebbe un ingombro per la RNApolimerasi, però non ne sono sicuro.

______________________________________________

www.rjbentertainment.altervista.org/gallery.html

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