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lullaby
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16 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2009 : 18:50:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lullaby Invia a lullaby un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve, ho un esercizio sui VNTR ma non so proprio come procedere!

un individuo di cui è stato analizzato il DNA per 5 loci VNTR presenta il seguente profilo genetico:

(0.2)____
           (0.1)____
(0.1)____              (0.1)____               (0.07)____
           (0.1)____               (0.2)____   
                      (0.02)____                (0.1)____   
                                   (0.1)____



(ho inserito <<< per un problema di visualizzazione dei profili)
i diversi alleli per i vari loci VNTR hanno le frequenze riportate in parentesi. qual è la probabilità che un altro individuo preso a caso nella stessa popolazione abbia lo stesso profilo genetico?

grazie!!!

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 30 agosto 2009 : 01:15:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho modificato il tuo messaggio per renderlo più chiaro, se vuoi che il testo rimanga allineato utilizza il tag code: [code ][ /code]
(Come formattare il testo)
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lullaby
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16 Messaggi

Inserito il - 30 agosto 2009 : 15:13:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lullaby Invia a lullaby un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
bhè si..in effetti va meglio così..grazie!
qualcuno però mi aiuti anche con l'esercizio
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 16:19:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scusa ma non ho avuto tempo prima di ora di guardare con calma l'esercizio.
Secondo me il modo di procedere è questo:
- consideri uno alla volta i 5 loci
- avendo le frequenze alleliche dei due alleli calcoli la frequenza genotipica del genotipo eterozigote per quei 2 alleli (sarebbe lo stesso se uno fosse omozigote, calcoleresti la frequenza del genotipo eterozigote omozigote)
- moltiplichi fra loro le frequenze genotipiche di ogni singolo locus, questo perché sono eventi che si devono verificare simultaneamente

In pratica, partendo con il primo locus tu hai 2 alleli con frequenza 0.2 e 0.1, chiamiamoli p e q:
p = 0.2
q = 0.1
ovviamente la somma non da 1 perché questi non sono gli unici possibili alleli, ma nella popolazione ce ne saranno anche altri, non sai quanti ma per il calcolo non ti serve, ti spiego perché nel caso non ti sia chiaro.
Con 2 alleli avresti il classico binomio: (p + q)² = p² + q² + 2pq = 1
con 3 alleli avresti un trinomio: (p + q + r)² = p² + q² + r² + 2pq + 2pr + 2qr = 1
con 4 un quadrinomio... ecc...
ma quello che a te interessa è il "genotipo eterozigote" con i 2 alleli di cui hai la frequenza, quindi 2pq, ti basta avere le frequenze p e q per calcolarlo.
Quindi 2pq = 2 x 0.2 x 0.1 = 0.04 = 4%
poi fai lo stesso per gli altri loci e moltiplichi tutte le frequenze, così trovi la P totale che un altro individuo abbia quel genotipo.

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lullaby
Nuovo Arrivato




16 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 19:14:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lullaby Invia a lullaby un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie tante!!!
vi farò sapere come andrà l'esame!
ciao
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