Se volessi produrre una proteina ricombinante da indirizzare ai mitocondri delle cellule di mammifero trasfettate, che caratteristiche dovrebbe avere la sequenza di localizzazione da utilizzare? in quale posizione del costrutto la inserirei?
non c'č una sequenza segnale (MTS, mitochondrial targeting signal) univoca, ma sono sequenze ridondanti. dovresti fare delle prove, magari facendo degli allineamenti 3D tra la struttura tridimensionale della tua proteina e quella delle proteine mitocondriali di cui si conosce bene l'MTS, poichč tale sequenza segnale potrebbe cambiarti il folding. Quel che č certo č che l'MTS č una sequenza posta all'N-terminale della proteina, č ricca in arginina (quindi ha una carica netta positiva), e in genere si struttura a formare un'alfa-elica.