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Autore

Discussione

Mareluna
Nuovo Arrivato

Prov.: Treviso

16 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2006 : 22:38:04

Ciao a tutti!! avrei bisogno di un aiutino: mi servirebbero alcune info sul gene tbr1 in Danio rerio! ho appena iniziato il tirocinio in cui dovr� studiarne il pattern di espressione; mi han detto che di questo gene � noto ben poco, ma vorrei sapere qualcosina in + del semplice fatto che � un fattore di trascrizione importante x lo sviluppo!
Sono ore che bazzico in rete ma non ho trovato molto...qualcuno ha qualche suggerimento!?
Grazie a tutti!!
ciao ciao

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 09 maggio 2006 : 13:26:30

Innanazitutto puoi partire da Ensembl, dove tbr1 e' annotato:
http://www.ensembl.org/Danio_rerio/geneview?gene=ENSDARG00000004712
Se giochi un po' con le 'DAS SOURCES', puoi ottenere informazioni da altri database.

Poi per Zebrafish c'e' addirittura un server dedicato (http://zfin.org), e da li' puoi trovare delle informaz. sull'espressione di questo gene (http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-xpatselect.apg&query_results=exist&START=0&searchtype=contains&gene_name=tbr1&stage_start=ZDB-STAGE-010723-4&stage_end=ZDB-STAGE-010723-39&mutsearchtype=contains&mutant=&MOsearchtype=contains&MOgene=&authsearchtype=contains&author=&assay=ANY&TA_selected_structures=&xpatsel_processed_selected_structures=&include_substructures=checked&structure_bool=and&xpatsel_jtypeDirect=checked&xpatsel_jtypePublished=checked&xpatsel_recentRecords=&WINSIZE=25&xpatsel_calledBySelf=true)
Puoi controllare che questa ricerca sia giusta? Non ho mai usato questo server.

Se ti puo' essere utile un confronto con l'uomo (o forse e' meglio il topo), puoi trovare abbastanza, per esempio se UCSC (http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgNear?hgsid=71117274&org=Human&db=hg18&near_search=tbr1&submit=Go%21&near_order=expGnfAtlas2&near.count=50 -> espressione in Homo Sapiens!!), oppure potresti dare un'occhiata a quello che trovi con questo motore di ricerca (harvester.embl.de): http://harvester.embl.de/harvester/Q166/Q16650.htm

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)