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babayaga
Nuovo Arrivato
Città: Torino
4 Messaggi |
Inserito il - 01 dicembre 2009 : 20:35:37
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correggetemi se sbaglio: i miRNA solitamente riconoscono il loro mRNA target in modo speficico giusto? ecco.. ma come è possibile che silenzino l' mRNA target e non altri visto che solitamente hanno una sequenza che ibrida solo parzialmente con la sequenza bersaglio( del tipo 7 o 8 nucleotidi al 5' del miRNA complementari - loop di circa 8 nucleotidi e poi di nuovo 4 o 5 basi al 3' complementari)? posso dire da un punto di vista probabilistico che qst miRNA rinonosce un solo mRNA??? oppure posso ipotizzare che questo abbia piu di un target??
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Saretta
Utente Junior


Prov.: Roma
Città: Provincia di Roma
263 Messaggi |
Inserito il - 01 dicembre 2009 : 21:31:08
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Allora calma.. un singolo microRNA ha centinaia di differenti target! proprio perchè la regione del miRNA di appaiamento con gli mRNA target è così piccola! (Questa regione è detta seed) E c'è di più, un mRNA target avendo il 3'UTR molto lungo possiede molte regioni di legame con diversi miRNA! Quindi schematizzando -un miRNA ha centiaia di diversi target -un mRNA può essere target di diversi miRNA |
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Dionysos
Moderatore
  

Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 01 dicembre 2009 : 23:45:05
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Quoto saretta e aggiungo che non tutti i trascritti in grado di ibridare con il miRNA per complementearietà sono reali targets.
Un target è per definizione qualcosa che viene regolato dal miRNA in modo biologicamente rilevante, ovvero un trascritto che ha subito una pressione evolutiva per conservare determinate sequenze di legame e che subisce alterazioni significative nei livelli di traduzione quando il miRNA che lo regola viene aggiunto o tolto.
Questo non esclude che ciascun miRNA possa legarsi a trascritti cosiddetti 'offtarget', ma se non esiste una rilevanza biologica per questo tipo di interazione allora succederà che i trascritti offtarget perderanno con l'evoluzione questa caratteristica fino a subire un livello di regolazione sostanzialmente non detectabile.
Non esiste un bianco o nero: tanti trascritti potranno interagire con un miRNA e subire il processo di repressione, ma solo alcune specie di trascritti (dalle decine alle centinaia per miRNA) verranno regolate in maniera biologicamente rilevante.
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Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà (F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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babayaga
Nuovo Arrivato
Città: Torino
4 Messaggi |
Inserito il - 02 dicembre 2009 : 18:20:21
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grazie grazie grazie.. mi avete chiarito le idee!  |
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