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amelietta
Nuovo Arrivato

21 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2009 : 16:06:54

Ciao a tutti, io vorrei sequenziare oltre il mio gene di interesse, come posso fare? Mi spiego...vorrei sapere che sequenze ci sono vicino al promotore e vicino alla 3'UTR del mio gene. Che faccio, metto la mia sequenza in un database e, sfruttando le sequenze nuove che riesco a trovare mi disegno dei nuovi primer e procedo via via cosÃ¬? Ma poi, come faccio a sapere "dove mi trovo"? Devo sempre immettere le mie sequenze nuove su database e cosÃ¬ via?Avete qualche database da consigliarmi?
grazie
ps ho fatto una valanga di domande.....

nomis
Nuovo Arrivato

Città: roma

16 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2009 : 16:57:15

mica ti ho capito!!!!!!!!! mmmmm non capisco comunque se utilizzi programmi come BLASt "lanci" la tua sequenza e sai "dove ti trovi" e a cosa corrisponde... di lì ci sono i link ad altri programmi che ti permettono di avere le sequenze per 100 200.... che ne so 10000 up stream o down stream...e tra l'altro ti dicono anche se in queste sequenze ci sono siti per fattori di trascizione e cos' via... dipende da cosa stai cercando...

amelietta
Nuovo Arrivato

21 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2009 : 19:22:39

ciao nomis, lo so che non mi sono spiegata benissimo

usando BLAST non mi pare perÃ² che ci siano (almeno io non li ho visti...) "i link ad altri programmi che ti permettono di avere le sequenze per 100 200.... che ne so 10000 up stream o down stream" se ci fossero sarei felicissima!! comunque hai capito benissimo perchÃ¨ ciÃ² che voglio sono proprio sequenze up stream o down stream.