Quanto è utile/interessante questa discussione:
| Autore |
Discussione |
|
|
Dany87
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
 Inserito il - 31 gennaio 2010 : 12:40:07
|
Qualcuno mi può aiutare?
Nel seguente reincrocio, i geni "a" e "b" sono distanti 20 cM e "b" e "c" sono distanti 10cM:
a+c/+b+ X abc/abc
Se il coefficiente di coincidenza è di 0,5, quanti tripli omozigoti recessivi saranno attesi in una progenie di 1000 individui?
Io ho fatto così:
Interferenza=1-c= 1-0,5=0,5 cioè 50%
DCO= 0,2*0,1*50/100=0,01
poi non so se devo solamente moltiplicare *1000 ottenendo 10
o anche dividere per 2 ottenendo 5...
grazie!
|
|
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 31 gennaio 2010 : 20:04:53
|
Certo devi anche dividere per 2, perchè 10 è il totale dei DR, ma metà saranno abc e metà +++.
 |
 |
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2010 : 11:35:42
|
scusate ma non ho capito questo passaggio:
Citazione:
Messaggio inserito da Dany87
DCO= 0,2*0,1*50/100=0,01
perchè moltiplica anche per l'interferenza...? |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2010 : 12:25:03
|
Perché se c'è interferenza i doppi ricombinanti "osservati" non sono uguali agli "attesi" (calcolati moltiplicando le 2 frequenze) ma devi tener conto dell'interferenza.
In realtà non ci ho fatto caso perchè in questo caso l'interferenza era 0,5 e di conseguenza in coefficiente di coincidenza è uguale, ma bisognerebbe moltiplicare per il coefficiente di coincidenza non per l'interferenza.
In ogni caso se hai altri dubbi sull'interferenza ti consiglio di andarti a vedere gli altri esercizi risolti sull'interferenza, ci sono tante discussioni dove è spiegato.
|
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2010 : 13:50:28
|
ah ok...ma se ad esempio devo calcolare il COC, ma l'esercizio non mi dà l'interferenza, come faccio a trovarlo? oppure calcolo gli attesi semplicemente moltiplicando le due distanze per il totale e quindi poi applico la formula COC= DR osservati/Dr attesi...?
grazie |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2010 : 14:18:30
|
Beh dipende cosa ti chiede l'esercizio e che dati ti dà, comunque la formula è sempre questa: CC= DR oss./DR att.
ma almeno 2 dati devi averli per ricavare il terzo, altrimenti è impossibile! |
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 15:18:36
|
uhm...provo a esporti l'esercizio già risolto, in modo breve:
ho un reincrocio, l'ordine dei geni è cn c px; l'esercizio mi chiede di calcolare le varie distanze che sono:
cn-c = 0,23
c-px= 0,17
cn-px= 0,35---> questa distanza viene calcolata sommando le distanze delle due regioni diviso il totale, senza prendere in considerazione i doppi ricombinanti (DR=25 in totale) perchè la loro somma è inferiore alla somma delle due distanze (Ireg+IIreg); cosa vuol dire questo??
Poi, mi chiede di calcolare il COC, quindi mi calcolo i DR attesi: distIreg X distIIreg= 0,23X0,17=0,0391 quindi calcolo i DR oss.=25/1000= 0,025 e infine applico la formula COC= 0,0391/0,025=1,564.
E' corretto così...?
grazie |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 20:31:23
|
No scusa ma mi sono persa già all'inizio, qual'è il testo dell'esercizio e i dati che hai? Che cosa invece hai trovato tu?
Scritto così non si capisce niente.
Comunque:
Citazione:
l'ordine dei geni è cn c px.........
cn-px= 0,35---> questa distanza viene calcolata sommando le distanze delle due regioni diviso il totale
la distanza tra cn e px è la somma della distanza tra cn e c e tra c e px e basta! Non diviso "il totale" e poi il totale di cosa? |
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 21:46:07
|
Pensavo si capisse, ho omesso i dati perchè l'avevo già risolto e non volevo farti perdere troppo tempo...
Femmine di drosophila sono state incrociate con il triplo recessivo +++/+++ x cn c px/cn c px
cn c px= 296
cn c += 63
+ + px= 82
cn + += 119
+ c px= 86
cn + px= 10
+ c += 15
+ + += 329
tot. 1000
cn-px= 63+82+119+86/1000= 0,35 giusto? (la prof.l'ha risolto così) non avevo capito perchè non considero i DR.
cn-c= 119+86+10+15/1000= 0,23
c-px= 63+82+10+15= 0,17
L'altro dubbio riguardava il calcolo del COC, ho scritto nel messaggio sopra il procedimento, ma non so se è giusto...
|
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 00:30:27
|
Citazione:
Pensavo si capisse, ho omesso i dati perchè l'avevo già risolto e non volevo farti perdere troppo tempo.
Si solo che senza dati non si capiva bene come erano state calcolate le distanze, sopratutto questa frase:
Citazione:
cn-px= 0,35---> questa distanza viene calcolata sommando le distanze delle due regioni diviso il totale, senza prendere in considerazione i doppi ricombinanti (DR=25 in totale) perchè la loro somma è inferiore alla somma delle due distanze (Ireg+IIreg); cosa vuol dire questo??
In realtà è stata calcolata sommando i ricombinanti tra le due regioni diviso il totale....
altrimenti se dici "le distanze" sembra che sia stato fatto: 0,23 + 0,17 / totale (e qua non si capiva che totale fosse)
Comunque sia, sinceramente non so dirti perchè la tua prof non abbia preso in considerazione i doppi ricombinati, anzi a dirla tutta io non l'averei neanche calcolata considerando i doppi ricombinanti, ma la distanza tra i due geni "esterni" per me è data dalla somma delle 2 distanze, quindi: 0,23 + 0,17 = 0,40
(se la calcolassi considerando i doppi ricombinanti invece verrebbe 0,375).
Per questo ti conviene chedere alla tua Prof.
Per il calcolo del coefficiente di coincidenza invece hai invertito la formula!
La formula è: c = fr.DR oss/fr.DR att
tu hai fatto invece: fr.DR att/fr.DR oss
|
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 10:26:26
|
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina
Comunque sia, sinceramente non so dirti perchè la tua prof non abbia preso in considerazione i doppi ricombinati, anzi a dirla tutta io non l'averei neanche calcolata considerando i doppi ricombinanti, ma la distanza tra i due geni "esterni" per me è data dalla somma delle 2 distanze, quindi: 0,23 + 0,17 = 0,40
(se la calcolassi considerando i doppi ricombinanti invece verrebbe 0,375).
forse mi sono espressa male io (come al solito eheh), ma nel calcolo cn-px NON sono stati inclusi i DR!! cioè lei ha sommato i ricombinanti in I e II regione (non le distanze)e poi li ha divisi per il totale e viene fuori 0,35. E ci ha detto che non considera i DR perchè è un numero inferiore alla somma delle due distanze...ma sinceramente io l'avrei risolto come dici tu, anche perchè al tutorato hanno seguito il tuo ragionamento.
Citazione:
Per il calcolo del coefficiente di coincidenza invece hai invertito la formula!
La formula è: c = fr.DR oss/fr.DR att
tu hai fatto invece: fr.DR att/fr.DR oss
a parte l'errore idiota che ho fatto, è giusto calcolare i DR attesi come ho fatto io? o devo moltiplicare anche per il totale?
grazie, e scusa la confusione...
|
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 11:35:00
|
Citazione:
Messaggio inserito da morgana83
forse mi sono espressa male io (come al solito eheh), ma nel calcolo cn-px NON sono stati inclusi i DR!! cioè lei ha sommato i ricombinanti in I e II regione (non le distanze)e poi li ha divisi per il totale e viene fuori 0,35. E ci ha detto che non considera i DR perchè è un numero inferiore alla somma delle due distanze...ma sinceramente io l'avrei risolto come dici tu, anche perchè al tutorato hanno seguito il tuo ragionamento.
Sì, sì poi avevo capito. Anche se continuo a non capire il ragionamento della prof....
Citazione:
Messaggio inserito da morgana83
a parte l'errore idiota che ho fatto, è giusto calcolare i DR attesi come ho fatto io? o devo moltiplicare anche per il totale?
grazie, e scusa la confusione...
Beh in realtà la risposta c'è già nel mio precedente post,la formula è: c = fr.DR oss/fr.DR att
quindi devi mettere nella formula la "frequenza", non il "numero" (che otterresti moltiplicando per il totale), oppure pruoi mettere i numeri di entrambi (osservati e attesi) al posto delle frequenze.
Se poi l'esercizio di chiedesse anche qual'è il numero dei DR. attesi allora dovresti moltiplicarlo per il totale.
|
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 11:49:44
|
ok quindi se faccio DR att= 0,23x0,17=0,0391
DR oss= 10+25/1000=0,035
COC= 0,035/0,0391=0,9
è corretto?? |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 15:13:27
|
Citazione:
Messaggio inserito da morgana83
DR oss= 10+25/1000=0,035
e 10 da dove salta fuori adesso???
semplicemente devi fare il contrario di quello che avevi fatto prima, visto che avevi invertito la formula:
Citazione:
Messaggio inserito da morgana83
COC= 0,0391/0,025=1,564
ti ho detto:
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina
La formula è: c = fr.DR oss/fr.DR att
tu hai fatto invece: fr.DR att/fr.DR oss
quindi non ti resta che invertire:
COC= 0,025/0,0391=0,639 |
|
|
|
morgana83
Nuovo Arrivato
44 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2010 : 15:57:39
|
sono troppo fusa...sarà l'ansia pre-esame ma sono veramente nel pallone e sbaglio anche le cose più ovvie.
grazie mille |
|
|
| |
Discussione |
|
|
|
Quanto è utile/interessante questa discussione:
| MolecularLab.it |
© 2003-18 MolecularLab.it |
|
|
|
ultimo aiuto per esercizio genetica
