taq polimerasi

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35 Messaggi

Inserito il - 14 febbraio 2010 : 16:47:10

scusate ragazzi ...sto ripetendo la fase di polimerizzazione nella PCR ..
L'attivita' di polimerizzazione della taq polimerasi � di circa 35-70 bp al secondo??? questo � quanto scritto dai miei appunti ma sinceramente pensavo molto di piu'...

Neuroscience
Utente

659 Messaggi

Inserito il - 15 febbraio 2010 : 13:12:15

Bhe c'� una certa differenza tra 35 e 70 bp al secondo...
in effetti la velocit� dipende da diversi fattori, dalla temperatura alla sequenza stessa di amplificazione.
Io so che la Taq, a regime, fa abbondantemente pi� di 60.000 basi al minuto, ovvero pi� di 1.000 basi ogni 10 secondi, ovvero pi� di 100 basi al secondo (mediamente).
E' ovvio che devi contare che c'� un tempo di latenza abbastanza alto prima di iniziare effettivamente ad amplificare e poi l'efficienza diminuisce ad ogni ciclo di PCR.

L'unico articolo che ho trovato e che ne parla � questo
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8324500
per la Taq classica, cita 130 basi/s a 75�C

quindi il valore che hai riportato � effettivamente un po' sottostimato, bisognerebbe capire il perch�, magari calcola una media tra tempi di latenza, sequenze difficili etc.