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Parauallr
Nuovo Arrivato
Città: Nocera Inf. (SA) - Roma
92 Messaggi |
 Inserito il - 29 maggio 2010 : 22:21:28
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Salve ragazzi. Piccolo problema. Cito testualmente il mio testo:
"I promotori per la RNA polimerasi II si trovano all'estremità 5' di ciascuna unità di trascrizione, sebbene l'enzima inizialmente stabilisca interazioni ad entrambi i lati del sito di inizio della trascrizione. [...]Questa regione spesso contiene una sequenza di consenso che è identica o molto simile all'oligonucleotide 5'-TATAAA-3', conosciuto anche come TATA box.
Ora, se la polimerasi lavora sul filamento neosintetizzato di RNA in direzione 5'>3', lavora su quello stampo di DNA in direzione 3'>5'. Quindi, l'estremità 5' è quella a valle del segmento da trascrivere. A meno che la TATA box non si trovi sul segmento senso, identico all'RNA. Ma non mi risulta...
Insomma, c'è qualcosa che non torna
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Caffey
Utente Attivo
Città: Perugia
1496 Messaggi |
Inserito il - 29 maggio 2010 : 22:38:21
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La TATA box sta in tutti e due i filamenti; se ci pensi è anche palindromica come sequenza.
Te la descrive in quel modo perché si fa riferimento al filamento senso quando si parla di sequenze.
Per chiarirti un attimo la questione ho trovato questa immagine.
Spero di essere stato utile!
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[...] Hunc igitur terrorem animi tenebrasque necessest
non radii solis neque lucida tela diei
discutiant, sed naturae species ratioque. [...]
Titus Lucretius Carus |
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 29 maggio 2010 : 22:44:30
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| non capisco quale sia il problema... cos'è che nn hai capito? Dove sta la TATA box? In genere si trova una ventina di nucletoidi (lunghezza variabile) a monte del transcription start site. A monte vuol dire direzione 5' del coding strand: in genere si prende in esame la sequenza sul coding sense, per convenzione. E la TATA box sta sul coding sense sì (ma ovviamente non viene trascritta sull'mRNA). |
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 29 maggio 2010 : 22:49:33
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Citazione:
Messaggio inserito da Caffey
La TATA box sta in tutti e due i filamenti;
Esatto: in realtà questi enzimi non è che riconoscono solo una semplice sequenza TATA su un filamento... ma riconoscono e interagiscono con questi nucleotidi e con i loro nucleotidi complementari...
Per quanto riguarda la palindromia, la TATA box non è esattamente palindromica,si tratta di una consensus di questo tipo TATAAA o TATAAT (o altre varianti).
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Parauallr
Nuovo Arrivato
Città: Nocera Inf. (SA) - Roma
92 Messaggi |
Inserito il - 29 maggio 2010 : 23:52:03
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Citazione:
[i]a monte del transcription start site. A monte vuol dire direzione 5' del coding strand
Ok, era questo il problema: non mi era chiaro se il filamento da prendere in considerazione era il coding o il template, anche se effettivamente mi rendo conto che questa è una di quelle volte in cui mi perdo in un bicchier d'acqua :D
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Posizione TATA Box
Didattica
