ciao a tutti ho qualche quesito da porre a proposito di genetica molecolare.. 1- come faccio a scoprire se un frammento di DNA che ho clonato contiene un gene e in caso positivo la sua funzione? 2- come dall'analisi di una sequenza si può dedurre struttura e funzione del gene contenuto? 3- perchè l'identificazione di geni mediante l'analisi di omologie può esser fatta confrontando sia sequenze nucleotidiche che proteiche?
punto 2 e 3. a)ovviamente il più usato e banale da capire è quello con sequenza proteiche. ossia si va a confrontare le sequenza aminoacidiche di 2 proteine per trovare regioni o domini con sequenze simili o addirittura uguali. questo perchè ci sono dei domini che corrispondono ad una funzione specificati da una specificha sequenza, per esempio il dominio catalico di una proteina chinasi e spesso simile e molto conservato da punto di vista evoluzionistico e ci dirà quindi che il gene ignoto lavora come una proteina chinasi, o almeno ne ha le potenzialità b)il confronto di sequenze nucleotidiche è lo stesso importante per esempio nel caso dei piccoli RNA non codificanti, spesso hanno delle strutture caratteristiche dettate dalla sequenza e confrontandole potremmo riconoscere se il gene in questione codifica per un piccolo RNA che avrà la funzione di silenziare altri mRNA bersaglio.