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Barbaryna
Nuovo Arrivato
47 Messaggi |
 Inserito il - 20 dicembre 2010 : 11:13:08
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 ciao di nuovo!!avrei da fare un altra domanda, cos'è una sequenza consenso??grazie!!!
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 20 dicembre 2010 : 13:36:36
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Si tratta di una sequenza di quei nucleotidi, o di quegli amminoacidi, che ricadono piu' frequentemente in una posizione e quindi in un determinato ordine. La sequenza consensus è ricavata dall'allineamento di piu' sequenze correlate ed è come detto sopra composta da quelle unità che compaiono maggiormente in tale allineamento, in quella particolare posizione.
Generalmente hanno una funzione regolatrice (pensa alla sequenza consensus di un promotore o di un particolare dominio proteico) o di indirizzamento (le sequenze segnale delle proteine per esempio).Questi sono solo alcuni esempi...
Viene da sé che le sequenze consensus possono anche variare leggermente tra di loro, conferendo potenzialmente differenti caratteristiche. |
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Caivs.Ivlivs
Utente Junior
Città: Brescia
302 Messaggi |
Inserito il - 20 dicembre 2010 : 13:37:16
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Citazione:
Messaggio inserito da Barbaryna
ciao di nuovo!!avrei da fare un altra domanda, cos'è una sequenza consenso??grazie!!!
Dipende un po' dal contesto. In generale, possiamo definire "sequenza consenso" una sequenza di nucleotidi che, nella sua unicità, ha la proprietà di riconoscere determinati siti a livello di determinati complessi proteici o ribonucleoproteici, in modo tale da legarli e consentire loro di esplicare la loro attività catalitica.
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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
Inserito il - 23 dicembre 2010 : 23:36:28
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Citazione:
Messaggio inserito da SpemannOrganizer
...Generalmente hanno una funzione regolatrice....
Citazione:
possiamo definire "sequenza consenso" una sequenza di nucleotidi che, nella sua unicità, ha la proprietà di riconoscere determinati siti a livello di determinati complessi proteici
Vorrei sollevare una questione sulla definizione:
Non basterebbe definirla come una sequenza nucleotidica o aminoacidica, che con una certa significatività statistica, si mantiene invariata?.
Parlate poi di funzioni di riconoscimento o di regolazione, ma questo, a mio avviso, esula dalla definizione, anche perchè non possono essere proprietà generalizzate di una consensus.
potrei parlare di una consensus presente in un sito promotore, di una consensus aminoacidica presente nel sito catalitico di un enzima, ma se esistesse una sequenza conservata in un introne, senza nessuna funzione apparente, anche questa dovrebbe essere definita "consensus".
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"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 24 dicembre 2010 : 08:29:29
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| ma se nn avesse una funzione specifica, che siq regolatrice o meno, perche allora dovrebbe essere conservata?Il fatto che sia conservata, nella sua sequenza, vuol dire che è stata selezionata (ed è selezionata)per rimanere tale, perchè evidentemente ha una certa funzione... |
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sequenza consenso
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