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Discussione |
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marco_86
Nuovo Arrivato
Prov.: parma
Città: salsomaggiore
18 Messaggi |
 Inserito il - 21 dicembre 2010 : 07:21:48
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non ho ben capito il ruolo degli aspartati su ogni subunità c del dominio F0 di membrana; prendono i protoni e li passano ma come si genera la rotazione della sunità gamma?
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nashita
Utente
Prov.: Puglia
1085 Messaggi |
Inserito il - 21 dicembre 2010 : 17:20:20
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Citazione:
Messaggio inserito da marco_86
non ho ben capito il ruolo degli aspartati su ogni subunità c del dominio F0 di membrana; prendono i protoni e li passano ma come si genera la rotazione della sunità gamma?
La rotazione dipende dalla subunità a, dalle subunità c e dai protoni.
Ciascuna catena della subunità c è costituita da una coppia di alfa eliche che si estendono da una faccia all'altra della membrana. Sulla seconda elica in particolare vi è un Aspartato. L'aspartato sarà neutro quando si trova a contatto con l'ambiente idrofobico della membrana.
Le 9 o 12 subunità c si organizzano a formare un anello transmembrana.
Mentre la struttura della subunità a bisogna immaginarsela così con due semicanali :
Immagine:
213,21 KB
i due semicanali non sono quindi aperti ad entrambi i lati. Quindi i protoni che entrano da un lato non possono uscire dall'altro lato e dunque non attraversano la membrana. La subunità a si trova a contatto con due subunità c in modo che ciascun semicanale si trovi a contatto con una subunità c.
All'interno dei due semicanali vi è un ambiente idrofilico per cui i due aspartati ,ciascuno di una subunità c si trovano carichi in quanto hanno perso un protone. Così facendo l'anello non potrebbe ruotare in nessuna direzione perchè si verrebbero a trovare poi Asp carichi in un ambiente idrofobico della membrana.
Essendo la concentrazione dei protoni più alta nell'ambiente citosolico , rispetto a quello della matrice, un protone può muoversi dall'ambiente citosolico dentro il semicanale citosolico (condizione favorita anche dal potenziale di membrana). Quando un protone entra, così va a protonare l'aspartato portandolo alla forma neutra e così permette la rotazione di questo anello per porre l'aspartato ora neutro a contatto con la membrana.
Così facendo la subunità a si trova ora a contatto con una subunità c carica engativamente e una neutra. Quella neutra perde il protone, diventa carica. Entra un altro protone dal semicanale citosolico, protona l'aspartato e si ha rotazione e così via...
ti allego un'immagine sperando ti sia più chiaro...
Immagine:
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marco_86
Nuovo Arrivato
Prov.: parma
Città: salsomaggiore
18 Messaggi |
Inserito il - 21 dicembre 2010 : 19:30:20
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| grazie tante della risposta...adesso cerco di studiarla con calma spero di capire |
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nashita
Utente
Prov.: Puglia
1085 Messaggi |
Inserito il - 21 dicembre 2010 : 20:38:48
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| di nulla, cmq se non è chiaro...chiedi pure :P |
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marco_86
Nuovo Arrivato
Prov.: parma
Città: salsomaggiore
18 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2011 : 07:09:35
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ti chiedo se invece mi dici il meccanismo di sintesi nel dominio f1:
non ho capito se le 3 subunità beta possono esistere in due conformazioni o in tre...so che una è legata ad adp+pi, una ad atp ed una vuota, ma le conformazioni sono una ad alta affinità ed una a bassa o ce n'è un'altra?
e poi la sintesi avviene quando passano dall'una all'altra ok, ma il dg è vicino allo zero? non l'ho capito questo |
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