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Inserito il - 18 febbraio 2011 : 14:59:43

Ciao ragazzi durante lo studio dell'argomento in oggetto non riesco a capire una cosa.
Da quanto ho capito per costruire mappe fisiche sempre a pi� alta risoluzione posso usare gli STS e le EST per allestire mappe trascrizionali.
Quello che non riesco a capire � come si possono mappare sul genoma STS e EST. Ho letto che per STS le posso mappare con gli ibridi di radiazione e FISH. Ma con gli ibridi di radiazione io posso solo vedere se c'� associazione tra due STS e porle vicino ma non sapere su che cromosoma e che regione del cromosoma sono. A meno che conosca la posizione a priori di uno dei due STS. Quindi se parto da zero come faccio a sapere la loro posizione?
Con la FISH forse � pi� semplice... trovo il clone della libreria con STS con saggio pcr sulla libreria e da questo costruisco la sonda e poi mappo.
Ancora pi� semplice se uso un microsatellite gi� mappato precedentemente con mappa genetica appena trovo il clone dalla libreria so dove si trova.
Immaginando per� di non sapere nulla di due STS facendo pcr su radiation hybrid l'unica cosa che so � se c'� associazione ma non riesco proprio a capire come potrei mapparli.
Stessa cosa per le EST... come posso mapparle sul genoma con i radiation hybrids?
Mi sono perso qualcosa?
Grazie mille