Ciao e benvenuta su MolecularLab! 
Per favore leggi il regolamento e non postare la stessa cosa più volte, né come nuova discussione né come risposta ad altre discussioni altrimenti si genera solo confusione, una volta è più che sufficiente! Ho eliminato i doppioni del tuo messaggio.
In questa discussione: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=22220
a cui avevi risposto era spiegato l'esercizio, ma visto che non ti era chiaro rispiego qua passo per passo come si fa, magari sarà utile anche ad altri.
Abbiamo questi aschi ordinati:
45 5 146 1 10 20 15 58
ab+ ab+ ab+ ab+ ab+ ab+ ab+ ab+
+bc a++ ab+ +++ a+c ++c abc +b+
a++ +bc ++c abc +b+ ab+ +++ a+c
++c ++c ++c ++c ++c ++c ++c ++c
Calcolo distanza tra 2 geni:
Per calcolare la distanza tra 2 geni si utilizza la seguente formula
(1/2T + DNP)/TOT
Innanzitutto devi considerare 2 geni alla volta e individuare quali siano i ditipi parentali (DP), i tetratipi (T) e i ditipi non parentali (DNP).
Iniziamo con la coppia a-b, considerando solo a e b gli aschi sono questi:
45 5 146 1 10 20 15 58
ab ab ab ab ab ab ab ab
+b a+ ab ++ a+ ++ ab +b
a+ +b ++ ab +b ab ++ a+
++ ++ ++ ++ ++ ++ ++ ++
T T DP DP T DP DP T
ci sono solo DP e T e non DNP, prendi quindi i T e applichi la formula: (1/2T + DNP)/TOT (che diventa (1/2T)/TOT
a-b = 1/2 (45 + 5 + 10 + 58)/300 = 0.196 = 19.6cM
hai trovato la distanza tra a e b.
Ora fai la stessa cosa per le altre coppie di geni.
(scrivo solo il numero di aschi e il tipo)
b-c
45 5 146 1 10 20 15 58
T T DP T DP DP T DP
b-c = 1/2 (45 + 5 + 1 + 15)/300 = 0.11 = 11cM
a-c
45 5 146 1 10 20 15 58
DP DP DP T T DP T T
a-c = 1/2 (1 + 10 + 15+58)/300 = 0.14 = 14cM
Calcolo distanza gene-centromero:
Bisogna considerare un gene alla volta e vedere se segrega in prima o in seconda divisione meiotica, poi per il calcolo della distanza si utilizza la seguente formula:
1/2 (segreganti 2°)/totale
Consideriamo il gene "a":
- i segreganti in prima divisione meiotica saranno 2:2 (AAaa o aaAA)
- i segreganti in seconda divisione meiotica saranno 1:1:1:1 (AaAa) e 1:2:1 (AaaA o aAAa)
quindi:
45 5 146 1 10 20 15 58
a a a a a a a a
+ a a + a + a +
a + + a + a + a
+ + + + + + + +
2° 1° 1° 2° 1° 2° 1° 2°
Per gli altri geni invece ho:
b45 5 146 1 10 20 15 58
1° 2° 1° 2° 2° 2° 1° 1°
c45 5 146 1 10 20 15 58
2° 1° 1° 1° 2° 2° 2° 1°
Applicando la formula: 1/2(segr. 2°)/tot
a-centromero = 1/2 ( 45 + 1 + 20 + 58)/300 = 0.207 = 20.7cM
b-centromero = 1/2 ( 5 + 1 + 10 + 20)/300 = 0.06 = 6cM
c-centromero = 1/2 (45 + 10 + 20 + 15)/300 = 0.15 = 15cM
L'ordine dei geni sapendo tutte le distanze è banale:
O----b----c-----a
Esercizio su Neurospora Crassa
Inserito il - 09 maggio 2011 : 14:34:35
