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 Sequenza promotori RNA polimerasi
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Daldal
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35 Messaggi

Inserito il - 04 giugno 2011 : 16:27:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Daldal Invia a Daldal un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ragazzi salve, qualcuno di voi conosce le sequenze dei promotori della Rna polimerasi nei geni Eucariotici? Non riesco a trovarle... se foste così gentili da scriverle!! grazie mille!!

Daldal
Nuovo Arrivato



35 Messaggi

Inserito il - 05 giugno 2011 : 10:26:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Daldal Invia a Daldal un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Nessuno mi risponde?? almeno potete dirmi dove cercare?Sono disperata! Comunque qualcuno di voi sa se il metodo dell'idrolisi acida per rilevare le sequenze metilate corrisponde al metodo di analisi di Maxam e Gilbert? Grazie
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zerhos
Utente Junior

ZERHOS

Prov.: Pisa
Città: Pisa


421 Messaggi

Inserito il - 05 giugno 2011 : 17:07:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di zerhos  Invia a zerhos un messaggio ICQ Invia a zerhos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Utilizzando Genome Browser puoi scaricare la sequenza del tuo gene e anche quello che c'è a monte di esso.
Nel link quì sotto vai direttamente nella sequenza di RNApol2, POI scegli te quanta sequenza a monte del gene visualizzare (sotto la voce Promoter/Upstream by).

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=197346649&g=htcGeneInGenome&i=uc002ghf.3&c=chr17&l=7387849&r=7417929&o=knownGene&table=knownGene

ah! dimenticaco, la sequenza è di H.sapiens, non so se è questa quella che cerchi.

"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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GiordanoL
Nuovo Arrivato



23 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2015 : 10:24:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GiordanoL Invia a GiordanoL un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok. Ti riporto un articoli che ho scritto per BioPills:

La Trascrizione è il processo necessario per ottenere il ”Trascrittoma”, ovvero l’insieme di molecole di RNA, derivate da geni codificanti proteine, che la cellula richiede in un preciso momento. Questo processo è mediato dalle RNA Polimerasi.

Il processo di trascrizione è guidato dalle RNA Polimerasi e possiamo dividerlo per comodità in due fasi:

Inizio trascrizione: Assemblaggio proteine nella regione a monte del gene prima di copiarlo in un trascritto di RNA.
Sintesi e maturazione RNA
In entrambe le fasi la RNA Polimerasi è sempre presente e guida il processo.

Ogni RNA Polimerasi è una proteina, composta da più subunità, strutturalmente simili ma funzionalmente diverse.

Qui E.Coli- E’ presente una sola Polimerasi che è in grado di riconoscere autonomamente la sequenza per l’inizio della trascrizione, il promotore.

Il promotore di E.Coli è composto da due subunità:

Regione -35
Regione -10
L’inizio della trascrizione corrisponde al momento in cui avviene l’assemblaggio del complesso di inizio della trascrizione. Nei batteri la Polimerasi si lega direttamente al promotore grazie alla subunità #948; (enzima core) che riconosce la regione -35 e fa attaccare la Polimerasi dalla regione -35 alla -10. Il complesso di inizio della trascrizione al momento è ”chiuso” e va reso aperto, ciò accade grazie alla collaborazione tra le subunità #948; e #946; che rompono l’appaiamento tra le basi intorno alla regione -10.


Qui Eucarioti- La trascrizione dei geni nucleari eucariotici richiede tre RNA Polimerasi:

RNA Polimerasi I: Trascrive unità ripetute in copie multiple dei geni per gli rRNA
RNA Polimerasi II: Trascrive geni che codificano proteine
RNA Polimerasi III: Trascrive tRNA
I promotori eucariotici sono più complessi, non c’è soltanto il promotore core ( sito al quale si lega il complesso) ci sono anche elementi promotori a monte. Ognuna delle tre Polimerasi riconosce sequenze diverse, la Polimerasi II riconosce due segmenti del core del promotore:

Regione -25/ Tata Box
Sequenza iniziatrice/ Nucleotide +1
Le Polimerasi eucariotiche non riconoscono le sequenze promotore core, per la Polimerasi II il contatto iniziale è stabilito da GTF ( fattore generale di trascrizione TFIID). GTF è composto da proteine che legame Tata box e 12 fattori associati. Il legame con Tata box genera una curvatura di 80°-90° nel DNA e si allarga il solco minore. A questo punto entra in gioco TFIIB che ha contatti con Tata box attraverso il solco minore allargato e lega il suo motivo di riconoscimento nel solco maggiore. Queste associazione generano il corretto posizionamento della Polimerasi. Il complesso però ancora non è attivo, per esserlo, necessità di una fosforilazione al dominio C-Terminale (CTD) della subunità più grande della Polimerasi II.
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