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 pcr real time e profilo allelico
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sandrina84
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1 Messaggi

Inserito il - 15 giugno 2011 : 10:25:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di sandrina84 Invia a sandrina84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti, sono nuova del forum. Ho un grossissimo problema, nn solo nn ho mai fatto una PCR, e nn solo qui in lab da me nn c è nessuno che mi possa aiutare, ma devo anche mettere a punto una pcr real time per poter discrimare il mio gene di interesse in 3 ceppi diversi della stessa specie, dove ciascun ceppo ha un profilo allelico diverso. Mi spiego meglio : il mio gene si chiama groEL,
nel ceppo batterico A ho 1 allele;
nel ceppo batterico B ho 2 alleli;
nel ceppo batterico C ho 3 alleli;
HO una sola coppia di primer e nn 3....premesso questo, la mia idea di partenza è quella di iniziare dal ceppo piu semplice con un allele e mettere a punto la 1° pcr per ottenere una curva di melting ad una detrminata temperatura...e già qui nn so da dove devo partire....ma subito dopo io mi dovrei aspettare che per il ceppo con 3 alleli dovrei ottenere 3 diverse curve di melting giusto??? ma quanto diverse tra loro? tipo 80°C 81°C 82°C???
come faccio a mettere a punto questa pcr dall inizio? grazie mille a tutti

thejoint84
Nuovo Arrivato



46 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2011 : 22:37:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di thejoint84 Invia a thejoint84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
I tre alleli sono uguali o molto simili immagino..... secondo me non trovi tre curve di melting per il ceppo con tre alleli... ma una curva che ha un andamento diverso da quella del ceppo con un allele!!!!

http://cornermolecularbiology.blogspot.com/
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