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 sequenziamento di sanger
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Ch3rry
Nuovo Arrivato



8 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 14:57:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ch3rry Invia a Ch3rry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve..una domanda...nel momento in cui devo svolgere il sequenziamento di Sanger, su che base scelgo i primer visto che il frammento da sequenziare ha una sequenza di basi incognita?

roberta.s
Utente Junior

yeast

Cittā: Parigi


564 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 15:03:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di roberta.s Invia a roberta.s un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Perchč incognita? il genoma é stato sequenziato per intero in H.sapiens, M.musculus, E.coli, S.cerevisiae, ecc ecc ecc!
Vedi "progetto genoma" per l'organismo che ti interessa, troverai il relativo "genome database" con tutte le sequenze che vuoi!
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Ch3rry
Nuovo Arrivato



8 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 17:17:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ch3rry Invia a Ch3rry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
no...xkč questa č esattamente la domanda che mi ha fatto un professore all'esame :)
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roberta.s
Utente Junior

yeast

Cittā: Parigi


564 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 17:42:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di roberta.s Invia a roberta.s un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vuoi sapere come č stato sequenziato per la prima volta il genoma?
Se no, la risposta č quella che ti ho dato prima.
Se si', il genoma č stato frammentato ed ogni frammento č stato inserito il un vettore per ottenere una libreria genomica. a quel punto semplicemente si scelsero i primer complementari alla regione del plasmide upstream e downstream l'inserto.
vedi qui http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer.shtml per dettagli ed immagini
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chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 18:13:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dubito che Sanger avesse accesso ai dati del progetto genoma

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roberta.s
Utente Junior

yeast

Cittā: Parigi


564 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 18:18:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di roberta.s Invia a roberta.s un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dai! Infatti ho risposto:)
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Cittā: Paris, VIIčme arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 18:49:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si era discusso di un simile problema: qui
Riassumendo...


Citazione:
Messaggio inserito da DIETIL.

ciao.......mi sapete dire cosa ha permesso la prima volta il sequenziamento manuale/automatico del dna......so come si svolge il sequenziamento pero nn capisco come sono riusciti a conoscere la sequenza esatta dei singoli nucleotidi.............



Citazione:
Messaggio inserito da 0barra1

Caspita amicia, mi hai battuto sul tempo di una manciata di minuti. Anche io ho pensato la stessa cosa, trovando conferma nel fatto che il primo metodo introdotto, di maxman-gilbert, risale al 1973, mentre il sequenziamento di Sanger č del 1975.
Oltretutto il metodo M-G non necessita di primer.
Penso dunque che potrebbe essere questa la risposta



Citazione:
Messaggio inserito da zerhos

no,all epoca si risaliva al primer da aggiungere identificando e purificando frammenti di restrizione del DNA,nel caso specifico DNA fagico,phiX174 fu il primo ad essere sequenziato dal gruppo di Sanger.



So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

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