Ciao a tutti, avrei bisogno di un'informazione. ho avuto un grosso problema di contaminazione: i miei campioni di DNA sono tutti inquinati (circa 200). Dopo l'estrazione il DNA non era inquinato ma ho riscontrato il problema dopo l'amplificazione. è possibile che la causa sia la soda 0.1N che ho utilizzato subito dopo l'estrazione? Resiste il DNA in una soluzione di soda così concentrata?
Domanda: come fai a stabilire che prima dell'amplificazione il DNA non era inquinato? La soda a qualla concentrazione non rovina il DNA ma lo separa tutto il single strand.
grazie per la risposta velocissima! ne sono abbastanza sicura perchè sono stati estratti contemporaneamnete (stessi reagenti ecc) anche altri campioni che alla successiva analisi non hanno dato problemi. Stiamo comunque verificando facendo delle analisi con i marcatori microsatelliti e, temendo che la causa più probabile fosse la soda, volevamo capire se era plausibile!