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Autore

Discussione

283
Nuovo Arrivato

115 Messaggi

Inserito il - 02 luglio 2012 : 09:53:17

ciao a tutti..ecco una questione che vorrei porre sperando che possa essere utile anche ad altri.

dalla real time che ho fatto il mio housekeeping � uscito con un ciclo (nel peggiore dei casi) di differenza tra un campione e l'altro. quindi penso che non sia per niente buono come risultato. qualcuno di voi sa dirmi a cosa pu� essere dovuto.

si tratta di rna estratto da cellule umane. la qualit� dell'rna era buona.
inoltre con questo rna � stato fatto un microarray ma io nn sono in grado di capire i microarray per cui se per qualcuno sapesse anche dirmi se real time e microarray si possono usare in parallelo..ne sarei davvero grata!!
grazie in anticipo ragazzi

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 02 luglio 2012 : 13:04:35

beh, credo proprio di si che si possano usare in parallelo. Di solito, per motivi economici, si fa l'una o si fa l'altra. Nulla toglie per� di farle entrambe, anche per avere una conferma indiretta (tenendo sempre a mente che le due tecniche hanno finalit� differenti). Esempio, se il tuo housekeeping � tale, non dovresti trovare grossi fold change nel microarray, o sbaglio?

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

Gabry
Nuovo Arrivato

Prov.: Ancona
Citt�: santa maria nuova

64 Messaggi

Inserito il - 03 luglio 2012 : 09:41:37

una differenza di 1 ciclo tra campioni pu� dipendere da diversi fattori. a partire dallo strumento fino ad arrivare alla procedura di estrazione. se due campioni hanno una differenza di un ciclo per gli housekeeping non vedo dove st� il problema. si risolve semplicemente calcolando il DCT e il mistero � risolto. Quello che interessa � la differenza tra target e HK non il valore grezzo dei ct.

283
Nuovo Arrivato

115 Messaggi

Inserito il - 20 agosto 2012 : 12:51:03

Citazione:
Messaggio inserito da Gabry

una differenza di 1 ciclo tra campioni pu� dipendere da diversi fattori. a partire dallo strumento fino ad arrivare alla procedura di estrazione. se due campioni hanno una differenza di un ciclo per gli housekeeping non vedo dove st� il problema. si risolve semplicemente calcolando il DCT e il mistero � risolto. Quello che interessa � la differenza tra target e HK non il valore grezzo dei ct.

grazie per la risposta.
ci� che intendevo � che tra i vari campioni l'hsk esce a cicli diversi e il Dct cambia molto tra un campione e l'altro..quindi volevo sapere se questi dati sono utilizzabili lo stesso oppure no.