Qualcuno sa dirmi se e con che criterio posso modificare manualmente il threshold in un'analisi qRT-PCR?
Utilizzo un Rotor-Gene Q che mi calcola automaticamente il threshold delle mie corse. E' capitato però che diversi campioni abbiano lo stesso CT, perciò l'analisi quantitativa non fornisce un CT ma dà negativa la quantificazione perchè in presenza di multi-CT.
Ho provato ad aumentare manualmente il threshold e in effetti man mano che aumento il suo valore mi "escono" i vari CT (ovviamente i CT che già erano presenti cambiano valore).
La mia domanda quindi è: se cambio il threshold del gene di riferimento, come faccio a sapere di quanto devo cambiare il threshold del gene di interesse per mantenere il rapporto e quindi una corretta quantificazione?