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amicia
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24 Messaggi

Inserito il - 28 settembre 2012 : 11:00:20

Ciao a tutti,
scusate la domanda un po retro, ma qualcuno sa dirmi come, consocendo la sequenza genomica in termini di numero di bp di un genoma batterico, stabilirne il peso del genoma espresso in grammi?
Se possibile potreste anche citarmi la referenza della formula che suggerite?
Grazie mille in anticipo

GFPina
Moderatore

Città: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 28 settembre 2012 : 12:50:04

Il peso medio di un nucleotide è 330Da, quindi quello di una coppia di basi e 660Da.
Ovviamente è una media dei 4 nucleotidi che non hanno tutti esattamente lo stesso peso.
Il PM di una molecola di DNA non è altro che: 660 x n°bp
poi si tratta solo di fare le dovute proporzioni per arrivare ai grammi.

Riguardo alla referenza, beh si tratta semplicemente di una media calcolata sui PM dei 4 nucleotidi che tra l'altro ti potresti anche calcolare anche tu conoscendo il peso atomico dei vari atomi e la composizione dei singoli nucleotidi. Comunque basta che cerchi "peso medio nucleotide" e troverai tantissimo materiale, una referenza ufficiale di certo non c'è.

amicia
Nuovo Arrivato

24 Messaggi

Inserito il - 01 ottobre 2012 : 16:10:50

Cara GFPina,
ti ringrazio molto per la tua risposta per una domanda un po banale. Quindi 660 x n° bp e ottengo il peso di una mole di genoma. A questo punto divido per il numero di avogadro (6.02 x 10E23) e dovrei ottenere il peso in grammi di una singola molecola di genoma. Sei d'accordo? Ti ringrazio molto per il tuo aiuto

GFPina
Moderatore

Città: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 01 ottobre 2012 : 19:09:48

Sì esatto!

Prego.