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Dalila909
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20 Messaggi |
 Inserito il - 24 gennaio 2013 : 17:32:27
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La mappatura fisica o genomica di un genoma avviene prima del sequenziamento (shotgun o clone by clone) o è una conseguenza di esso???
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cicchi
Nuovo Arrivato
57 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2013 : 13:10:46
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| Sto studiando anche io questo argomento e da quanto ho capito per vedere il punto esatto del frammento clonato che ibridizza con la sonda devi fare una mappa di restrizione. Ma andando a digerire con un solo enzima di restrizione otteresti tanti "pezzi" del tuo frammento disordinati per questo fai una doppia digestione quindi ti ricavi la mappa fisica del frammento e a quel punto solo del "pezzo" che ha ibridizzato con la sonda fai il sequenziamento |
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Dalila909
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2013 : 19:11:21
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| Mi sono documentata e in realtà puoi fare una mappa di restrizione digerendo parzialmente il genoma (se grande) con enzimi di restrizione rarecut i cui siti di riconoscimento sono più grandi quindi formi meno frammenti e più grandi il modo che ti posso uscire un buon risultato dopo l'elettroforesi su agarosio. O fare una mappatura STS (che è poi stato quello che ha fatto venter della celera genomic all'inizio del progetto di sequenziamento del genoma umano). In questo puoi ibridare i cloni che ti crei durante la procedura del sequenziamento (ad es. shotgun)con le sequenze contenute nella libreria in cui hai il genoma mappato. |
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Mappe e sequenziamento
Didattica
