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emi24
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40 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 15:44:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di emi24 Invia a emi24 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,
avrei bisogno di un vostro parere....
per un esperimento di trasfezione con miRNA in cui ho 4 condizioni di cui 2 trattate con un agente per indurre apoptosi e 2 senza agente quindi ad esempio ho

controllo
miRNA
controllo +TRAIL
miRNA + TRAIL

e misuro la vitalità o la frammentazione del DNA di queste cellule misurando l'assorbanza, i valori di assorbaza ottenuti vanno normalizzati per qualcosa? o posso mostrare i dati senza alcuna normalizzazione?

Vi ringrazio,

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 17:07:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sicuramente io normalizzerei per il numero di cellule

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emi24
Nuovo Arrivato



40 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 18:17:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di emi24 Invia a emi24 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,
potresti spiegarmi meglio cosa significa normalizzare per il numero di cellule?
E' la prima volta che ne sento parlare.

Ti ringrazio per lo spunto di riflessione
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 19:15:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh, prova ad immaginare cosa succederebbe se nel tuo controllo avessi 2 milioni di cellule e nel gruppo siRNA 1 milione... potresti dire che il tuo segnale diminuisce del 50% anche se il tuo siRNA non avesse alcun effetto...

L'idea è di:

1) cercare di piastrare lo stesso numero di cellule in tutti i gruppi
2) contare quante cellule hai in ciascun gruppo
3) dividere la tua misura per il numero di cellule o, in alternativa, per avere valori più "comodi", metti il tuo controllo come 100%, calcoli la % di cellule negli altri gruppi e moltiplichi i valori di conseguenza.

Ad es. se il tuo controllo ha 1.1 milioni di cellule e il gruppo siRNA ne ha 1.3 milioni, tieni ctrl = 100% e siRNA = 1.3/1.1 = 118%. Quindi moltiplicherai la misura del gruppo siRNA per 1.18.

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