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Mat
Nuovo Arrivato

85 Messaggi

Inserito il - 23 marzo 2013 : 12:06:23

Salve a tutti, non so se � corretto questo posti in questa sezione o era meglio la bioinformatica. Comunque sto cercando gli NM di riferimento su NCBI per i geni Patched e GLI1 solo che per il primo ci sono moltissime forme di splicing per il secondo 3. Qualcuno di voi sa come faccio a ricavarmi il NM di riferimento o anche semplicemente il numero del NM per questi geni?
Grazie mille a chi risponder�!

Gingy88
Nuovo Arrivato

56 Messaggi

Inserito il - 24 marzo 2013 : 13:38:34

nella scheda di gene card, sotto le forme di splicing c'� scritto "unigene representative sequence", penso sia l'NM preso come riferimento

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 25 marzo 2013 : 18:24:55

Dove cerchi in NCBI?
Devi cercare dal database "GENE" (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene) e trovi la "pagina" del gene che ti dice tutto, scorrendo trovi tutte le sequenze di riferimento da quella genomica e quella di RNA con la relativa proteina.
Non hai detto in che organismo ti serve quindi ti ho fatto la ricerca per Uomo, nel caso non fosse quello puoi rifarla tu.
Per Patched ci sono ben due geni:
PTCH1: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/5727
PTCH2: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8643

GLI1:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2735

Mat
Nuovo Arrivato

85 Messaggi

Inserito il - 29 marzo 2013 : 20:50:11

GRAZIE!!!! Non serviva farmi gi� da te le ricerche, comunque graz

Buona Pasqua!