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Shiva11_83
Nuovo Arrivato
42 Messaggi |
 Inserito il - 05 aprile 2013 : 15:42:55
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Ciao ragazzi! mi potete dare una mano su un piccolo enigma? 
sto valutando l'espressione genica di alcuni geni mediante qRT-PCR e relativa metilazione del promotore. Per alcuni geni ho visto un andamento dell'espressione corrispondente al loro livello di metilazione (ovvero, più diminuiva l'espressione genica, aumentava il livello di metilazione, e viceversa). Per altri geni questo non avveniva; per esempio avevo una diminuzione dell'espressione genica a fronte di una metilazione praticamente assente. Mi sono chiesta quali sono i meccanismi alternativi alla metilazione che possono causare un silenziamento genico. Me ne sono venuti in mente alcuni:
1) presenza di siRNA per quel gene
2) modificazioni istoniche
3) alterazioni a livello cromatinico
4) localizzazione del gene a livello nucleolare (qua andiamo un pochino nella fantascienza)....
altro?? ho l'impressione che mi sfugga qualcosa.... grazie mille!!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
 Inserito il - 05 aprile 2013 : 16:46:37
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1) Diminuzione di un fattore di trascrizione per quel gene
2) Aumento di un fattore che inibisce la trascrizione del gene
3) Cambiamento dei livelli di qualche ormone |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
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Shiva11_83
Nuovo Arrivato
42 Messaggi |
Inserito il - 08 aprile 2013 : 15:54:28
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Citazione:
Messaggio inserito da domi84
n) Variazioni della degradazione/stabilizzazione di quegli mRNA
a questo ci avevo pensato anche io, ma mi ero dimenticata di scriverlo nel mio post.. ma grazie mille comunque per le vostre risposte :) |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1915 Messaggi |
Inserito il - 08 aprile 2013 : 17:03:54
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Ci sono anche sistemi che regolano l'espressione genica attraverso lo splicing, ad esempio l'NMD ( nonsense-mediaeted mRNA Dacay)
oppure sistemi in cui sono coinvolti i fattori di traduzione del messaggero, ad esempio come accade per la sintesi di GCN4,
anche l'ubiquitina ha un ruolo nella regolazione dell'espressione genica |
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Discussione |
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Diminuzione espressione genica ma no metilazione
Didattica
