Diminuzione espressione genica ma no metilazione

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Shiva11_83
Nuovo Arrivato

42 Messaggi

Inserito il - 05 aprile 2013 : 15:42:55

Ciao ragazzi! mi potete dare una mano su un piccolo enigma?

sto valutando l'espressione genica di alcuni geni mediante qRT-PCR e relativa metilazione del promotore. Per alcuni geni ho visto un andamento dell'espressione corrispondente al loro livello di metilazione (ovvero, più diminuiva l'espressione genica, aumentava il livello di metilazione, e viceversa). Per altri geni questo non avveniva; per esempio avevo una diminuzione dell'espressione genica a fronte di una metilazione praticamente assente. Mi sono chiesta quali sono i meccanismi alternativi alla metilazione che possono causare un silenziamento genico. Me ne sono venuti in mente alcuni:
1) presenza di siRNA per quel gene
2) modificazioni istoniche
3) alterazioni a livello cromatinico
4) localizzazione del gene a livello nucleolare (qua andiamo un pochino nella fantascienza)....

altro?? ho l'impressione che mi sfugga qualcosa.... grazie mille!!

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 05 aprile 2013 : 16:46:37

1) Diminuzione di un fattore di trascrizione per quel gene
2) Aumento di un fattore che inibisce la trascrizione del gene
3) Cambiamento dei livelli di qualche ormone

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domi84
Moderatore

Città: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 07 aprile 2013 : 20:15:39

n) Variazioni della degradazione/stabilizzazione di quegli mRNA

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

Shiva11_83
Nuovo Arrivato

42 Messaggi

Inserito il - 08 aprile 2013 : 15:54:28

Citazione:
Messaggio inserito da domi84

n) Variazioni della degradazione/stabilizzazione di quegli mRNA

a questo ci avevo pensato anche io, ma mi ero dimenticata di scriverlo nel mio post.. ma grazie mille comunque per le vostre risposte :)

Patrizio
Moderatore

Città: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 08 aprile 2013 : 17:03:54

Ci sono anche sistemi che regolano l'espressione genica attraverso lo splicing, ad esempio l'NMD ( nonsense-mediaeted mRNA Dacay)
oppure sistemi in cui sono coinvolti i fattori di traduzione del messaggero, ad esempio come accade per la sintesi di GCN4,
anche l'ubiquitina ha un ruolo nella regolazione dell'espressione genica