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enrica
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 26 settembre 2004 : 20:18:14
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Salve a tutti, sono una studentessa di biologia. Sto svolgendo una tesi che prevede la mutagenesi di singoli aminoacidi in una proteina e sto utilizzando il kit Quikchange site-directed mutagenesis della Stratagene. Il cDNA di questa proteina č stato clonato nel vettore pIRESpuro2, il quale contiene anche la resistenza all'ampicillina. Il mio problema č il seguente: dopo la trasformazione dei batteri con i costrutti ottenuti dalla PCR di mutagenesi ( dopo digestione di 2 h con DpnI) sulle piastre di LB broth+ Amp ottengo delle colonie ( il che mi fa presumere che in esse ci siano i plasmidi mutati o perlomeno quelli parentali). Quando poi faccio una miniprep ( con il kit della Sigma) di queste colonie, non ottengo assolutamente nulla, nč i plasmidi mutati, nč quelli parentali! Com'č possibile che questi batteri, che di per sč, non sono resistenti all'Amp, riescano a sopravviverci in assenza di alcun plasmide contenente la resistenza? Sono sicura che l'ampicillina funzioni e che le aliquote di batteri in uso non possano essere state contaminate in alcun modo. Grazie in anticipo per qualsiasi suggerimento!
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AleXo
Moderatore
Prov.: Estero
Cittą: San Francisco, California
1550 Messaggi |
Inserito il - 27 settembre 2004 : 18:34:55
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un integrazione del plasimde al cromosoma?mah.... Cmq, spassionatamente nonchč (purtroppo) x esperienza: mi sa ke fai prima a rifare tutto!!!!!!la biologia č cosģ no?!magari cambi qualke variabile, o metti un controllo in +.... Good luck!
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Ela
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
Inserito il - 21 giugno 2006 : 15:08:59
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Citazione: Messaggio inserito da enrica
Salve a tutti, sono una studentessa di biologia. Sto svolgendo una tesi che prevede la mutagenesi di singoli aminoacidi in una proteina e sto utilizzando il kit Quikchange site-directed mutagenesis della Stratagene. Il cDNA di questa proteina č stato clonato nel vettore pIRESpuro2, il quale contiene anche la resistenza all'ampicillina. Il mio problema č il seguente: dopo la trasformazione dei batteri con i costrutti ottenuti dalla PCR di mutagenesi ( dopo digestione di 2 h con DpnI) sulle piastre di LB broth+ Amp ottengo delle colonie ( il che mi fa presumere che in esse ci siano i plasmidi mutati o perlomeno quelli parentali). Quando poi faccio una miniprep ( con il kit della Sigma) di queste colonie, non ottengo assolutamente nulla, nč i plasmidi mutati, nč quelli parentali! Com'č possibile che questi batteri, che di per sč, non sono resistenti all'Amp, riescano a sopravviverci in assenza di alcun plasmide contenente la resistenza? Sono sicura che l'ampicillina funzioni e che le aliquote di batteri in uso non possano essere state contaminate in alcun modo. Grazie in anticipo per qualsiasi suggerimento!
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Dionysos
Moderatore
Cittą: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 21 giugno 2006 : 19:45:44
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Mhm..strano, il Quickchange dovrebbe essere un metodo ad altissima resa (e lo posso confermare).
Io perņ ho usato un vettore con promotore virale T7... e batteri del ceppo BL21(DE3), inducibili per la T7 polimerasi tramite IPTG.
Credo faccia parte del protocollo quickchange...o sbaglio? |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontą e della libertą (F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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