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Tag   complessità    genoma    C0t    DNA    denaturazione  Aggiungi Tag

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NanaBianca
Nuovo Arrivato



4 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 20:17:26  Mostra Profilo Invia a NanaBianca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti,
sto preparando l'esame di biologia molecolare e volevo capire effettivamente a cosa serve il valore c0t, è importante per determinare la complessità del genoma? Perchè si utilizza questo termine che associa due variabili?

Spero che potete aiutarmi a capire.

Grazie a tutti.

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 20:24:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In generale un tratto di DNA contenente delle sequenze ripetute si rinatura a tempi (quindi a C0t) più brevi.

Wikipedia lo spiega abbastanza bene: http://en.wikipedia.org/wiki/Cot_analysis
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NanaBianca
Nuovo Arrivato



4 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 20:55:39  Mostra Profilo Invia a NanaBianca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sì, ora però il mio dubbio era un altro, concentrandoci su DNA batterici e virali ci rendiamo conto che la curva di riassociazione è pressochè simmetrica in quanto le sequenze sono presenti tutte alla stessa concentrazione.
Il valore c0t in questo caso mi fa capire la complessità del genoma? Grazie.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 21:38:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dai un'occhiata a questo documento, che spiega il problema nel dettaglio:

http://biowiki.ucdavis.edu/Genetics/Unit_I%3A_Genes,_Nucleic_Acids,_Genomes_and_Chromosomes/Chapter_4._Genomes_and_chromosomes/Sizes_of_genomes%3A__The_C%E2%80%91value_paradox#Inverse_Relationship_between_Reassociation_Kinetics_and_Sequence_Complexity
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NanaBianca
Nuovo Arrivato



4 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 21:58:09  Mostra Profilo Invia a NanaBianca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ti ringrazio moltissimo. Volevo chiarimenti su un altro argomento, posso chiederlo qui oppure devo aprire un'altra discussione? Grazie.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 05 febbraio 2014 : 22:28:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Meglio un'altra discussione, così le cose restano più ordinate
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