Mate pair , pair ends e de novo assembly

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genoma assembly de novo mate pair pair ends

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Discussione

cloudany
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17 Messaggi

Inserito il - 11 novembre 2014 : 22:07:39

Ciao a tutti, ho eseguito una ricerca dei termini senza trovarnulla nel forum, mi spieghereste gentilmente queste tre tecniche che non ho ben chiare?
Si tratta di Mate pair, pair ends e de novo assembly,
vi dico ci� che so , per favore ditemi e/o integrate ci� che mi manca.

pair ends= leggo in ambo le direzioni una mia sequenza, pero come uso tali info durante l'assemblaggio di genomi (e le regioni ripetute Es.CG?)?

mate pair= so che prendo una sequenza da 2k di basi , circolarizzo inserisco una sequenza (biotenilata) e frammento in 500 o 600 basi.

de novo assembly= assemblaggio dei frammenti senza un genoma di riferimento?

Grazie per la disponibilit�